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小黑gg 小黑gg - 我是小黑,我為自己代言!~~ 綜合討論組

我的報告有疑問?。?!

父系祖源:O1b1a2a1
得出的應該是F779。
有網友說我的報告有問題,應該得不出 F779。
對話如下:

網友:F779明明是負數

我:那我的是父系:?O1b1a2a1??對照isogg和yfull得出?F779?啊?

網友:芯片有問題

網友:F779-,F4070-,F3262-。應該都是正,如果是F779的話

網友:你的報告都是負數

網友:但得出結論是F779肯定有問題啊

網友:你問他們吧

我:好的,我去問問。
2016-09-13 ? IP屬地蘇州
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10 個回復

wang - 哈佛醫學院、德國馬普所分子人類學博士后
你的分型是準確的,這個網友不太懂Y染色體譜系,誤會了WeGene
wang - 哈佛醫學院、德國馬普所分子人類學博士后
6383526 F779 A->G
7554377 F993 C->T
8907922 F4128 C->A
9098026 F4130 G->A
9104128 F1484 G->T
14001359 F1669 C->T
15989850 F2064 A->T
16285699 F2120 G->A
16330010 F2131 T->C
17111599 F2383 T->G
17188767 F2414 T->C
17767448 F2590 G->A
18553194 F2771 C->T
18835772 F2862 C->T
19400994 F3036 T->A
21618591 F3217 G->A
21837946 F3262 A->G
22550485 F3314 C->T
22587335 F3323 C->T
22698467 F3346 A->G
23573679 F3478 C->T
26134908 F3679 C->G
小黑gg - 我是小黑,我為自己代言!~~
是F779,那我的支系還有別的嗎?
wang - 哈佛醫學院、德國馬普所分子人類學博士后
F779不是唯一決定這一支系的SNP位點
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
首先要理解什么是SNP~ SNP指的是基因組里面一個可能出現變異的位點(比如說F779)。單倍體是根據分析人類的基因而總結出來的一些“分支”,這些分支是根據某些SNP的變異而界定的(比如說O1b1a2a1)。因此,隨著越來越多人參加基因測試項目,科學家通過對比分析就會發現更多的SNP,可能出現樹圖的分支有改變(比如說發現新分支)。微基因所得出的O1b1a2a1單倍體是以ISOGG發布的單倍體樹圖為標準。ISOGG是國際遺傳基因協會,它們公布的單倍體劃分被廣泛使用(每年都有更新,所以分支的稱呼也會出現改變的)。你所說的F799是另外一個組織Yfull用來識別O1b1a2a1分支的SNP位點而已,不是說你有或沒有這個SNP變異就會變得不屬于O1b1a2a1了。微基因只不過是根據另外一個標準的另外一組SNP來識別這個單倍體(分支)。
yaoxt - WeGene生信+遺傳咨詢師
ISOGG的O1b1a2a1跟YFull的F779應該是等同的,但兩者定義這個haplogroup的SNP是不同的。
ISOGG用的是這些:F1759, CTS5847, CTS8414, CTS11890, F2064, F3314, F3323, F3346, F3478, Z24393, Z24407

Yfull用的是這些:F2064 * CTS12981 * F779 F3314 * F2862 * F3217 * CTS10702 * CTS2976 * CTS8414 * F3346 * CTS5847 * CTS8039 * CTS9891 * F2383 * F2414 * CTS3707 * CTS4112 * F2124 * CTS11179 * CTS11890 * CTS2899 * CTS4485 * F1822/CTS3165 * CTS5445 * CTS6421 * F1484 * F3262 * F993 * CTS10154 * CTS10437 * F2590 * F3323 * CTS11033 * CTS9377 * CTS9574 * F2120 * F2131 * CTS8849 * F2771 * CTS2181 * F3135 * CTS7387 * CTS10677 * F1669 * CTS10406 * CTS2965 * CTS5188 * F1759 * CTS11437 * CTS4936 * F4128 * CTS11699 * F4070 * F4130 * F2872/CTS9364 * F3478 * CTS6920 * Z24381/CTS3094/PF2050

ISOGG跟Yfull所采用的SNP有7個重疊。

WeGene是根據ISOGG的標準來做的。ISOGG在這個haplogroup上有11個SNP,其中有6個SNP在WeGene的芯片。根據您的授權,我們查看了你的結果,這6個SNP是全部匹配O1b1a2a1的。所以,我們根據ISOGG的標準判斷你的Y Haplogroup是O1b1a2a1。

您提到的F799 SNP并不在ISOGG標準中,也不在我們的檢測芯片上。
小黑gg - 我是小黑,我為自己代言!~~
@yaoxt:這個藍色的還不是對應 F779 ?
20160913165244.png


QQ截圖20160913165144.jpg


QQ截圖20160913165202.jpg
yaoxt - WeGene生信+遺傳咨詢師
我門目前是以ISOGG的版本為參考的,目前用的Y SNP tree里,只有F3262在我們的list里面,F779和F4070都沒有在ISOGG這個版本的樹中。所以您的父系祖源結果,應該是因為O1b1a2a1下面其他的位點匹配到而得出的結果。在y 樹上鼠標移動到節點可以看到所有匹配上的位點(藍色),我們最近把位點名字也標注上了,您可以看看具體的匹配情況。
費力科思 - WeGene勤雜工
我檢查一下,謝謝反饋
小黑gg - 我是小黑,我為自己代言!~~
@wang @金剛石 @藍星旗 ?@dzau @chengang @所有大神 給我分析分析,是網友分析的有問題嗎?

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