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田園牧歌 田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因 綜合討論組

【新手先看】常見問題集(不斷更新)

與網友交流中較常出現的一些問題,通俗的回答,絕不專業,請專家指正~
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**所有單倍型應以SNP為準,以下使用ISOGG?2016年6月版命名**
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====關于產品====
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1. Wegene跟外國幾家公司(Ancestry, 23andme, etc)有什么區別?
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簡單來說,wegene的芯片設計考慮到我們東亞人群,芯片所測試的snp更有針對性。
wegene基本須知:http://www.sofreetech.com/page/help
具體的芯片對比:http://www.sofreetech.com/question/482
再專業的看白皮書:http://www.sofreetech.com/question/382??
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====關于祖源====

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如果不想讀那么多文字,那么就看一個視頻吧。看完就基本上理解分子人類學
相關的基本常識:
http://v.youku.com/v_show/id_XNjkxMjI0ODQ0.html?
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?1. 什么是單倍型/單倍群(Haplogroup)?

簡單來說,單倍型是用于把人類“分類”或者“分支”。科學家通過對比人類的基因,發現基因里的一些地方會出現突變(SNP),而這些突變會通過爸爸傳給兒子(父系/Y染色體)或者媽媽傳給女兒(母系/線粒體),形成一種“標記”。比如說,一個男性有三個兒子:甲、乙、丙。其中甲的基因出現了一個突變,那么這個突變會傳到甲的子孫身上,但是乙和丙的子孫就沒有這個突變。突變出現的概率很低,可能幾代、幾十代或更長時間才出現一次。科學家仍在分析和尋找這些“標記”來完善人類的“族譜”,所以您今天看到的單倍型也只是到目前為止所知道的“分支”,將來樹圖可能會出現調整的。

2. 是不是單倍型越短、祖源越久遠就越“原始”?

科學家根據上述的基因突變(SNP)繪制出人類的樹圖,有些人得出的單倍型很短(比如N1),有些人得出的單倍型很長(比如O2a2b1a1a1a1a)。其實越長只不過代表歷代累積下來的突變“標記”越多,跟原不原始沒有關系的。比如說甲出現了突變,傳下去幾百代后他的某個孫子出現了新的突變,再傳下去幾百代又出現新的突變...這些子孫就累積了很多突變的“標記”,單倍型的名稱就變得很長。甲的兄弟乙的子孫可能一直沒有出現突變,所以這些突變“標記”就很少,單倍型的名稱也就很短~ 當科學家發現某支之下有一些獨特的突變,那么科學家就會劃出新的分支,在原來的支系名稱上再加個數字或字母來代表下游的分支。隨著科學家獲得更多的數據,這個樹圖會不斷地調整,所以用戶們要注意網上一些論壇或文章中出現的單倍型名稱是以哪一年的版本為標準,因為有可能已經改名了。要知道最新的樹圖及命名方法,先要知道自己的單倍型是根據哪些突變來判斷的(SNP),再上ISOGG(國際遺傳基因組織)的網站找出自己的SNP,就可以知道新的名稱是什么了。

比如說,以前2008-2011年網絡的文章里較常出現的稱號:
原名稱 --> 對應的SNP --> 2016年新名稱
O1 --> SNP: M119 --> O1a
O2 --> SNP: P31 --> O1b
O3 --> SNP: M122 --> O2
O3a5 --> SNP: M134 --> O2a2b1
O3a4 --> SNP: M7 --> O2a2a1a2

2. 我的單倍型是Oxxxxx是不是代表我的祖先是某某地方的人?父系xxx母系xxx求解讀~

就如上面所說的,突變出現的概率很低,而科學在還在做相關的分析。你的父系是Oxxxxx只能說明你擁有這個單倍型定義里的一些突變,不能說明你是哪里人。有些地區的確會有些單倍型比較高頻,那只能說明出現這些突變的祖先可能源自那里或者周邊,但這指的是幾千、上萬年前的祖先,不能說明現在的“你”是哪里人或者你的近代祖先的具體遷徙路線是什么。

3. 是不是跟我一樣單倍型的人就是我的親戚?我能不能用單倍型的結果來找到親戚?

既然突變出現的概率很低,你跟別人有一樣的單倍型也只能說明你們可能幾千或上萬年前有一個共同的男祖先或女祖先(具體要看你的單倍型的共同祖先年代是多久遠)。如果“萬年親”在你的“親戚”定義之內,那么恭喜你,你可以找到很多親戚!但如果你所說的親戚是指近代的、同一個姓氏家族的,那么現在單憑單倍型是無法幫你找到親戚的~
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注意:單倍型的男祖先指的是你的爸爸的爸爸的爸爸的爸爸。。。。 女祖先指的是你的媽媽的媽媽的媽媽的媽媽。。。要記得你的祖先不是單線的,也不是雙線的,你的祖父母有2個人,曾祖父母有4個人,高祖父母有8個人,五代祖有16個人,六代祖有32個人,n代祖有2(n-1)個人。所以你所說的“親戚”范圍非常的廣,單倍型再具體也只是小部分而已~

4. 什么是祖源?我明明是南方人,怎么結果是北方漢族的?我祖宗十八代都是漢族,怎么會有少數民族血統?我祖先有韓國人?日本人?泰國人?柬埔寨人嗎?

大家不要把祖源想成祖籍或者姓氏來源,所謂的祖源只是一個模擬對比。也就是說,“南方漢族”可能是以現代南方某地方漢族的基因作為“標準”,“北方漢族”可能是以現代北方某地方的漢族作為“標準”。本來“漢族”就沒辦法定義的,祖源分析也只是拿著你的基因跟一些“標準”作對比,再分析出你的“祖源”結構。你有“韓國”或者“日本”的祖源也只能說明你的基因有一部分跟現代的韓國人和日本人相近。這并不代表你祖先來自韓國或日本。韓國、日本、東南亞人的一些祖先也有可能途徑中國區域散播過去,或者反過來,中國人的一些祖先也有可能從這些地方流傳過來。所以說“祖源”只是說明你跟現代的哪些群體比較接近,不是說你的祖先就是來自那里。你是江南人,但是“南方漢族”的成分很低,不代表你不是南方人,只是你跟“南方漢族”的“標準”群體不是很接近而已~
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要專業的解釋,請看:http://www.sofreetech.com/question/799?

5. 那么中國人的起源是怎么樣的?能否介紹一下?
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詳見專家分析:http://www.sofreetech.com/question/858??

6. 我看到網上說“40%的中國人的Y染色體來自三個新石器時代的超級祖先”是什么意思?
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就是有大約40%的漢族屬三個單倍型之下(超級祖先):
Oα,俗稱“農民甲”(O-M117, O2a2b1a1 --> O-F522,?O2a2b1a1a1a)占到漢族人口16%,擴張時間約5400年前
Oβ,俗稱“農民乙”(O-F444, O2a2b1a2 --> O-F46,?O2a2b1a2a1)占到漢族人口11%,擴張時間約6500年前
Oγ,俗稱“農民丙”(O-002611,?O2a1c?--> O-F11,?O2a1c1a)占到漢族人口14%,擴張時間約6800年前
再加上以下兩支,就占到漢族過半人口了:
O-M119?,O1a,在中國東南沿海、侗傣族群、臺灣原住民中集中分布,占漢族人口約10%,擴張時間約10400年前
C-F1144,C2c1,占漢族人口約10%,擴張時間約6500年前

可另外參考:
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http://blog.sina.com.cn/s/blog_465ddf790102vj8o.html??
http://blog.sina.com.cn/s/blog_465ddf790101ff19.html?

7. 上面這些單倍型我都不是哦,還有哪些單倍型比較典型?

O-M95,O1b1a1a:在華南、南方少數民族、中南半島及印度Munda人群中分布較多。
O-M176,O1b2:最主要集中于朝鮮半島、朝鮮族和日本人中。
O-M7,O2a2a1a2:在苗瑤和孟高棉人群中高頻出現,但在漢族中卻不足5%。

中國人先祖起源,詳見專家分析:http://www.sofreetech.com/question/858??
中國回族的起源,詳見專家分析:http://www.sofreetech.com/question/1086??

8. 已知的古代名人單倍型有哪些?
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除非能夠出土古DNA,古代名人的單倍型也只能間接推算出來(測他的子孫),已有成果的包括:
曹操家族:O2-M268,?O1b(詳見:http://blog.sciencenet.cn/blog-348453-558078.html?)
曹參家族:O-002611,?O2a1c(詳見:http://blog.sciencenet.cn/blog-348453-558078.html?)
愛新覺羅家族:C-M401,?C2b1a3a(詳見:http://blog.sciencenet.cn/blog-348453-853796.html?)
賽典赤、鄭和家族(納姓、馬姓):L-M76, L1a1(詳見:http://www.sofreetech.com/question/1086??)

9. 網友說測完wegene再測Y-str,有沒有必要呢?

有沒有必要就看你的目的是什么~ 以當今的數據量,還不能通過snp或者str來判斷姓氏族源的。現在來講,通過wegene測出父母系單倍型已經算是最精準的了。
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10. 怎么樣跟同單倍型的兄弟姐妹們見面?
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可以加入對應的QQ群,詳見:http://www.sofreetech.com/question/970
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====關于第三方服務====

1. 報告看完了,都過了一個月了,怎么原始數據還下載不了?
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從取樣到出原數據需要嚴格把關每一個步驟的,報告出來后一個月只是個大約時間,再過幾天就會出來的~ 你的基因值得你等待一下下!

2. 報告看完了,原始數據下載了,我還能怎么玩?

官方報告看完了,還有“微解讀”啊~ 給大家推薦幾個試一下:
馬路殺手要上路了!http://www.sofreetech.com/crowdsourcing/details/24
給語文成績差找理由!http://www.sofreetech.com/crowdsourcing/details/37
數學障礙:理科?文科?商科?http://www.sofreetech.com/crowdsourcing/details/83???
你的約會成功率有多高?http://www.sofreetech.com/crowdsourcing/details/44
補牙快要讓寶寶破產了!http://www.sofreetech.com/crowdsourcing/details/56
還有一些第三方的解讀服務是支持wegene的數據的,包括疾病解讀、親緣分析等,詳見:
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基因數據疾病數據庫注釋網頁版http://www.gene-disease.cn/??
RelationshipGO基因關系分析:?https://relationshipgo.xyz/??

3. 那是不是把原始數據上傳到gedmatch就可以找到親戚了?
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你可以試一下第三方的網站,但是gedmatch以美國及西方國家的用戶為主,中國人能找到近親的概率比較低。一般最接近的結果都是5 gen或以上,非常疏遠了。要找親戚,還是等wegene的親緣關系工具出來再試試看吧~
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4. 我把原始數據上傳到gedmatch,然后呢?

如何解讀,看這里:http://www.sofreetech.com/question/956
5. 我找到一些匹配的“親戚”,怎么判斷對方是什么公司測的呢?
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原始數據上傳gedmatch后,會獲得一個標識號碼,wegene用戶均為"W"字母開頭的,而其他公司則以其他字母開頭:
A = AncestryDNA
E = Geneticoncept
M = 23andme
T = FTDNA
W = Wegene
Z = 其他公司
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ISOGG最新的O和C單倍型樹圖與SNP(2016年6月)
2016-09-17 ? IP屬地中山
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42 個回復

田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
由于上ISOGG要翻*qiang,因此我把pdf版上傳到上面了~
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 9月19日新增:
O-F533,O1a1a1a1a1 ??
O-CTS2458,O1a1a1a1a1~
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
原始數據上傳gedmatch后,會獲得一個標識號碼,wegene用戶均為"W"字母開頭的,其他公司則以其他字母開頭:A = AncestryDNA
E = Geneticoncept
M = 23andme
T = FTDNA
W = Wegene
Z = 其他公司
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
2016年9月28日更新
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O1a1a1a2a:AM00330/AMM480/B386
O1a1a1a2a1:AM00333/AMM483/B387
O1a1a1a2b:SK1555
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田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
2016年10月5日更新
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O2a2b1a2a1a3b2b1a:FGC23868
O2a2b1a1a4a1a:Z42620
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
2016年10月7日更新
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O1b1a1a1a1a1-Z24081, Z24082, Z24085, Z24087
O1b1a1a1a1a1a-Z24083,?Z24086
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
Oα的定義是O-M117還是O-F522?
Oβ的定義是O-F444還是O-F46?
Oγ的定義是O-002611還是O-F11?
不同文章提供的snp不一樣的?@wang
幫忙頂置~
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
新增了一個微解讀,自己頂上去~
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2016年12月4日更新
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O2a2b1a2a1a2a1a增加F1458,F3387,F3614三個位點。
O-M119?,O1a,在中國東南沿海、侗傣族群、臺灣原住民中集中分布,占漢族人口約10%,擴張時間約10400年前,這不知道那個大專家做的。 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 國內的O1a有95%都是P203,大約占漢族的12%-13%左右,P203最近共祖是9000年左右O-M307 YTree https://www.yfull.com/tree/O-M307/。目前漢族的最常見支系是F81支系也就是CTS2458支系大概占漢族的8%左右擴張時間是4300年左右O-CTS2458 YTree https://www.yfull.com/tree/O-CTS2458/。
別外比較常見的是CTS52*和K644*,O-CTS52 YTree https://www.yfull.com/tree/O-CTS52/.這兩人支占漢族3%的人口,F81,CTS52*,K644*這三支占漢族O1a的85%左右,95%都是分布在漢族的。
? 侗傣族群的O1a很少占比才6%-7%左右,侗傣族群O1a主要是YP345,Y18196,CTS8920這三支為主和漢族支系分開是6-9千年。
? ?臺灣原住民主要類型是F168*和B388為主,和大陸支系分開6-7千年左右。
qqcoolj - O1a
這種帖子就應該置頂
wang - 哈佛醫學院、德國馬普所分子人類學博士后
南方漢族的標準并不是用的客家人
黃隆思 - 紅領巾三段
干得漂亮~
natsumi - 999用戶
請問到底是什么原因導致的基因突變哪?自然環境?為什么不同的環境里會有相同基因類型的人哪?
費力科思 - WeGene勤雜工
為啥沒有『贊賞』功能?
頂置
這樣的帖子可以出書了,贊一個
孫志軍 - gooday sunshine
我這批結果能趕上update嗎 意思修正一些功能不足和問題
費力科思 - WeGene勤雜工
好豐富啊
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
更新網址:基因數據疾病數據庫注釋網頁版 www.gene-disease.cn
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
isogg現已步入第12版了!
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年2月更新
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新增:O2a1c1a-F13,O2a1c1a1h-CTS2107,O2a1c1a1i-SK1691,O2a1c1a2-PH203
修改:O2a1c1a1-F11
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年2月更新
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O新增:O1b2a1a2a1b-A12446,?O1b2a1a2a1b1-PH40
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年2月更新
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C新增:C2c1a2a1a-F9966. F11237
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年2月更新
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O新增:
O2a1c1a1e1a1-Y26383
O2a1c1a1e2-FGC54486
O2a1c1a1e2a-FGC54507
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年2月更新
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O新增:
O2a2a1a2b-Y26403
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年2月更新
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O新增:
O2a1c1a1a1a1a1a1-F1418
O2a1c1a1a1a1a1a2-Z25097
O2a1c1a-F117
O2a1c1c-CTS498
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年3月更新
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O新增:
O2a1a1a1-F852
O2a1a1a1a1a-Z43961
O2a1a1a1a1a1-Z43963
O2a1a1a1b1-Z43966
O2a1a1b1a-Z43975
O2a2b1a2a1d-Y29828
O2a2b1a2a1d1-F735
O2a2b1a2a1d1a-FGC34973
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年3月更新
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O新增:
O2a2b1a1a1a2a1-F1442
O2a2b1a1a1a2a1a-F1123
O2a2b1a1a1a2a1a1~-F1369?
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年3月更新
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O新增:
O2b1a1-F1025
O2b2-F1055
O2b2a-F3021
對一些常見問題進行了科普,很不錯。
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年5月更新
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O新增:
O2a2b2a1a2-SK1780
O2a2b2a2b-AM01847
好貼
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年5月更新
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O新增:
O2a2b1a2b1a1-A16629
田園牧歌 - 追本溯源 · 微基因
ISOGG 2017年6月更新
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O新增:
O2a2b1a1a1a2a2-A16636
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n代祖的數量應該是2的n次方個
Recoco - 你好哇
幫忙??

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