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在寂寞中思索 在寂寞中思索 建議和反饋

我的y染數據怎么還沒有復查結果

本人的y染原先是D1a2,后來數據升級后變成了D1b2a2,由于結果十分罕見,本人和wegene工作人員進行了溝通,他們也懷疑結果有誤,一個多月過去仍然沒有給我復查結果,其間我多次聯系過對方,可對方一直沒有給我回復。如果連y染都不能給出一個相對明確的答案,那祖源分析有何意義?以下是相關圖片。
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2016-10-08 ? IP屬地中國
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8 個回復

@在寂寞中思索: 我聽一位genealogist講,23andMe在開始使用其v4芯片前(2013年底),沒有對Y染色體探針的定位做認真的試驗,造成了Y染色體位點測試的可靠性低;該公司的解決辦法是只報信號可靠的檢驗結果,導致Y染色體位點的未檢出率極高(45%-50%)。WeGene比23andMe測的Y染色體位點要多得多(約9倍),但由于芯片是不久前才定制的,又有很多新穎的位點,可靠性也偏低。WeGene的策略看來是發揮其測試位點多的長處,信號不太可靠的也報,靠比較陽性位點與陰性位點的比例而確定一個客戶的單倍群。這個策略在多數情況下顯然比較有效,但在一個單倍群的所知位點數少的情況下就很可能遇到困難。如果你想查明你的單倍群是否屬于某個更下游的分支,你可到YSEQ去查一下,其成本一般會比Family Tree DNA低得多。

WeGene的測試結果把我的父系單倍群從23andMe的測試結果往下游推了3步(從第4個字母到第7個字母),但在第8個字母上遇到了一些困難。最初的結果把我的單倍群推到了第8個字母,但在原始數據出來后,有一個關鍵的位點從有結果變成了無結果,又把我的單倍群拉回到了第7個字母。此后,我在YSEQ測了6個下游的位點,結果把我的單倍群又往下游推了兩步,到了第9個字母,而且排除了一個下游的分支。目前,YSEQ的測試結果已讓我在2016年ISOGG的Y樹上找到了我的單倍群的終端;當然,隨著Y樹研究的擴展,很可能會有更新的下游分支被發現。
費力科思 - WeGene勤雜工
這鍋得我背~~~~
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跟LZ交流過好幾次,我們發現了這個地方的一些問題。但如傳超所說,我們內部的討論一直在進行。我沒有及時反饋給LZ,很抱歉。
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CEO同學已經批評過俺了,他會跟樓主聯系處理的。
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抱歉~~
我承認你們工作很忙,但是做為消費者,我希望你們對客戶的重要數據負責一點。雖然我們已經付過費了,但wegene的口碑是需要積累的。
wang - 哈佛醫學院、德國馬普所分子人類學博士后
您好,近年來通過高通量測序在Y染色體上發現了大量的可能的譜系位點,但至今沒有在群體內對這些位點開展大樣本量的驗證,也就還沒有數據可以驗證D1a和D1b下游眾多位點的可靠性,您的這個情況是數據質量和現有Y樹精度造成的,而不是說您本身父系類型罕見。站在WeGene角度上,您的Y分型屬于D1;而根據我個人經驗,您很可能是D1a而不是D1b,因為您在D1b上的絕大多數位點均是陰性的,只有P190這一個是陽性,在D1b2上已有兩個您的陽性位點被ISOGG在譜系樹上移除了,后續也可能會把另外可能的陽性位點移除。期待后續更新!
wang - 哈佛醫學院、德國馬普所分子人類學博士后
您好,非常歉意給您造成了困擾!
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我們在接到您的反饋后第一時間(9月6日 15:30)專門討論了您的Y分型情況,我也去查了您的原始數據并親自核對了您的SNP突變情況,之所以無法準確對您的結果進行更下游分型的原因是您在D1a-F6251/Z27276以及D1b-P190上都有突變,并在D1a的下游D1a2-P99以及D1b2-Z14793, CTS3879, CTS8635, Z17171, Z1518上也分別有突變,原因可以歸為兩個:一是數據質量造成的假陽性,二是現有Y譜系樹在這些下游位點上準確性不夠。我們當時的結論是該樣本屬于D1但現階段無法判斷其屬于D1a還是D1b。非常歉意的是我們討論之后沒有及時向您反饋,對不起!
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D1a下游單倍群的判別的特殊之處在于沒有足夠多的位點,D1a僅有F6251/Z27276, Z27283兩個可用位點,D1a1僅有M15這一個位點,D1a2也是僅有P99這一個位點,假如恰恰這幾個位點上數據質量不好的話會對判別造成極大影響。而且對您的情況而言,在D1b2的下游您顯示陽性的兩個位點已在新版本的ISOGG上被移除,原因是不適合作為譜系識別位點,也就是說WeGene檢測了非常多的位點,這些位點現階段在Y譜系樹上的拓撲位置并不都是100%確定的而是在不斷更新的,相信后續會有更多的位點在譜系樹上的位置被證明或證偽,能夠進一步對您的Y進行更精細分型。
removed Z1515, Z14798, Z14799, Z14793, ?Z3801, Z3827, Z14795 not meeting quality guidelines on 4 June 2016.
Removed CTS7457, Z3822, Z14800, Z17171, CTS2259, CTS2940, Z14791, CTS11619, Z1507, Z14783, Z14784, Z24788 not meeting quality guidelines on 5 June 2016
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再次對沒有跟您及時反饋討論結果而表示歉意!
期間,我通過多種渠道將我的y染數據發給了國內的相關專業人員,有人認為此數據本身就存在問題,出于隱私及其它原因,我暫不想把他們的回復發在這里,我只希望你們給我一個負責的結果。
幫頂!!!

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