23andMe看來在區分蒙古、中國（漢族），韓國和日本的祖源成分時也有一些困難。比如，我的祖源分析報告最初說我有12%的蒙古成分、4%的韓國成分和1.2%的日本成分。但做了phasing以后認為我有12%%的韓國成分，而沒有任何蒙古或日本成分；同時又將我的孩子從我繼承的一部分DNA視為蒙古成分。另外，我家里的其他人也在23andMe測出相當可觀的蒙古或韓國成分（8%%-10%）；有的多是蒙古的，有的多是韓國的。

有效區分臨近的或有長期混血的現代人群是所有祖源分析都會碰到的難題。