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金剛石 金剛石 綜合討論組

祖源分析中,小數(shù)點如果保留三位小數(shù)的話?

看了祖源分析,很多人的0.00%的數(shù)值但名稱排序不同,因為wegene是按照比例排序的,看起來顯然是有數(shù)值的,只是小于0.005而已,能不能給顯示三位小數(shù)出來?

另一個問題,人只有46條染色體,祖源成分為何不是1/46的整數(shù)倍?
2016-12-22 ? IP屬地中國
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2 個回復(fù)

wang - 哈佛醫(yī)學院、德國馬普所分子人類學博士后
Hi
?
祖源比例是一個基于模型的模擬過程,本身的誤差就不止三位小數(shù),所以三位小數(shù)沒有任何意義,反而會造成誤導(dǎo);
?
祖源比例是基于SNP位點而不是基于染色體來算的,我們的基因組里有46條染色體但是有30億個堿基對呀。。。? ? 祖源分析是一個比較的過程,將你的數(shù)據(jù)和不同人群的進行比較來看你和哪些人群最相近、你可以模擬成由哪些人群按何種比例混合而成的等。主要是根據(jù)遺傳位點在人群中的頻率分布,簡單來講就是A位點的某分型在A人群中高頻出現(xiàn),而在其他人群中是沒有的或極低頻的,那我們就可以把A位點的這個分型認為是A人群的特征性位點。推算完這些位點的歸屬人群,那么我們只要數(shù)一數(shù)你基因組上的不同類別的遺傳位點的數(shù)目就大致得出了你的祖源成分。
hum
1.三位小數(shù)點完全沒有意義,誤差至少在1%左右(言下之意,1%以下的祖源成分基本可以意義忽略)。
2.染色體可以發(fā)生部分交換,你的每條染色體的不同區(qū)段都是很多個人的染色體反復(fù)多次交換后的結(jié)果。所以不是以染色體為單位計算的。另外不同染色體大小差別非常大,信息含量并不一樣。

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