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xuyaozhong xuyaozhong 父系單倍群O

為何23andme上顯示的結(jié)果與wegene綁定并分析23andme數(shù)據(jù)不一致?

23andme上父系顯示為O3a3c1*,wegene綁定數(shù)據(jù)分析為O3a2c?
這是什么原因?
2015-10-30 ? IP屬地中國
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2 個回復(fù)

wang - 哈佛醫(yī)學(xué)院、德國馬普所分子人類學(xué)博士后
很簡單,O3a3c1*是多年前的命名方式了,現(xiàn)在我們發(fā)現(xiàn)并在genotyping中使用了更多更細(xì)的東亞位點,東亞的O系已經(jīng)采用新的命名方式了,也就是之前的O3a3是現(xiàn)在的O3a2了。Y的命名中O3a...等是會不斷變化,重要的還是看SNP位點(比如:M134, M117, 002611等),所以最清楚的命名方式是“名稱-SNP”,譬如:O3a2c1a-M117。
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兩種可能:
?
1、23andme使用的ISOGG的版本是比較舊的,WeGene因為是新開發(fā)的,所以使用的是最新版的ISGOO的Y Hapogroup標(biāo)準(zhǔn);
2、分析方式差異。Y單倍群的定義雖然有ISOGG的標(biāo)準(zhǔn),但因為23andme所測的Y染色體上的位點數(shù)比較少,只有3000多個,所以無法完全根據(jù)ISOGG的標(biāo)準(zhǔn)來嚴(yán)格判斷,還需要通過一些概率或者機(jī)器學(xué)習(xí)的方法推測。這些方法的大體邏輯都是一樣的,但實現(xiàn)細(xì)節(jié)的差異會導(dǎo)致結(jié)果的細(xì)微差異。

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