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個人用戶拿到了fq數據，請問如何轉化成rs以及AGCT格式？

2015-11-27 ? IP屬地中國
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費力科思 - WeGene勤雜工
如果是全基因組數據，想使用WeGene的解讀的話。可以直接把Fastq文件通過硬盤寄給我們。
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自己做的話，一般可以參考GATK的best Practice。做QC，跑比對，cal變異，最后寫點簡單的腳本可以將其轉化為rsid和AGCT的形式。
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如果需要我們協助的話，請發郵件到[email protected]
wegene原始數據是什么格式？

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