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個人用戶拿到了fq數據,請問如何轉化成rs以及AGCT格式?

2015-11-27 ? IP屬地中國
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費力科思 - WeGene勤雜工
如果是全基因組數據,想使用WeGene的解讀的話。可以直接把Fastq文件通過硬盤寄給我們。
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自己做的話,一般可以參考GATK的best Practice。做QC,跑比對,cal變異,最后寫點簡單的腳本可以將其轉化為rsid和AGCT的形式。
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如果需要我們協助的話,請發郵件到[email protected]
wegene原始數據是什么格式?

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