
通過基因來檢測患癌幾率的一些看法
轉發下我在知乎上的一個回答:
首先要明確的一點是,癌癥的發病機理是十分復雜的。衣食住行方方面面都會對腫瘤的形成做出貢獻。以研究的比較多的乳腺癌為例,與發病率顯著相關的包括以下幾點:
這些風險中的“有乳腺癌家族史”這一項,有很大一部分就是遺傳的風險,也就是“基因”導致的患病風險。
要說明基因檢測是否能有效預測癌癥的患病風險,首先就要知道癌癥與基因到底有什么關系。
首先,癌癥與區別于其他疾病最重要的一點,就是它是一個“基因病”,幾乎所有癌細胞中都能找到明顯的基因突變。得益于測序費用的降低,最近幾年積累了大量的癌癥基因組的數據。比如TheCancerGenomeAtlas?Research?Network, TCGA,目前針對常見的癌癥都作了大規模的癌組織/正常組織的對比分析,數據包括基因組、轉錄組等各個組學,來看下乳腺癌的突變情況:
引用自:Comprehensive molecular portraits of human breast tumours, doi:10.1038/nature11412
為何癌癥基因組與正常組織差距如此之大?
現在主流的觀點,癌癥的發展和達爾文的進化論有很大的相似之處。癌細胞不斷的分裂過程中,基因組也在不斷的變異,有更高的生存優勢的細胞接積累的越多。
Wellcome Trust Sanger Institute在他們的一篇乳腺癌論文中,通過超高深度的全基因組測序,發現乳腺癌的發展并不是一蹴而就的,而是通過不斷的基因突變的積累,乳腺才從完全正常的組織,一步步發展成高度復雜的,有多種癌細胞亞克隆群體的癌組織。在這一過程中,在最早的祖先癌細胞出現前,乳腺細胞就已經有了驅動癌癥發生的突變,如PIK3CA,TP53,ERBB2,?MYC,?CCND1等。這些腫瘤驅動基因的突變(driver gene mutation),會大大增加乳腺癌的患病風險。 (話說當年看到這個paper真是佩服的一塌糊涂,單個樣本高深度測序就能把這么復雜的過程給推測出來了,媽媽問我為什么跪著看論文……)
所以驅動突變的出現,就相當于朝著癌癥邁進了一小步。而很多驅動突變,都是在被稱之為
腫瘤抑制基因(tumor suppressor gene)和原癌基因(oncogene)上的。比如在乳腺癌的風險基因中,最常被提及的BRCA1及BRCA2,都是腫瘤抑制基因。它們的主要功能是參與DNA損傷修復,和維持基因組的穩定性。如果這兩個基因發生影響其功能的變異,則腫瘤驅動基因的突變出現的時候難以被有效的修復,乳腺細胞癌化的可能性就會大大增加,甚至也會增加其他癌癥的風險。
所以,基因和腫瘤有沒有關系?答案很明顯,有關系,而且還不小。
如題主所說,目前市場上已經開始出現很多基因檢測來預測癌癥風險的產品了,有類似安吉麗娜·朱莉那樣的測完整的BRCA1/BRCA2的基因來推測乳腺癌風險的,也有檢測一堆多態性(SNP)位點,來評估相對風險的。
這些檢測,靠譜嗎?
我個人的判斷是,大部分的這類檢測至少都是有一定科學依據的。在癌癥的研究方面,我們積累的數據量已經很多很多了,大部分的癌癥都做過易感性的研究,結合這幾年測序技術在癌癥領域的應用,高頻率的driver gene mutation也找的差不多了。所以參與這些檢測,如果真的檢測結果是高風險的話,受檢測者確實需要多警惕,注意進行恰當的癌癥風險管理。
比如像朱莉那樣,BRCA1/BRCA2上發現純合且顯著改變基因功能的突變,可能終生的患病風險能到80%以上。這樣的情況下,切除乳腺組織就是非常理性的選擇。而且市面上已經出現了降低得乳腺癌的風險的藥物,如他莫昔芬,雷洛昔芬等。就算不手術,不服藥,單純的增加體檢頻率,早起發現癌癥的話也能極大提高患者的5年生存率。
現在回到題主的問題上來,為什么國內的群眾大多不認可或者是覺得沒有必要呢?
我覺得主要有以下幾點:
1. 最重要的一點,是大家對基因檢測的不了解。不做基因這塊領域的,對基因是什么基本沒有比較清晰的概念,大家最能說得上來的可能是“克隆”、“轉基因”之類的概念。不是聽起來像魔法,就是在輿論中被妖魔化了。而真正做這塊的,也大部分在科研醫療機構,對民眾的宣傳科普的工作做得并不好。
2. 第二點,是基因檢測推斷癌癥風險并不能完美預報個體的患病風險。不像單基因病,突變ó得病幾乎是完全對應的關系,基因、遺傳并不是導致癌癥的唯一因素。乳腺癌為例,大概只有10%的乳腺癌是可以確切證明是由遺傳導致的。剩下的90%?基因檢測發現不了這些風險。而且限于成本,目前B2C市場的大多數檢測產品,都是對少部分基因、位點的檢測,不可能覆蓋全基因組的解讀。
3. 第三點,是沒有很好的風險管理的辦法。雖然NCCN發布過《breast cancer risk reduction》、《genetic/Familial high-risk assessment:Breast cancer and pvarian》等指導性的風險評估和降低風險的指南,但是國內有條件,而且有意愿按照指南健康管理的機構并不常見。對于普羅大眾,抽煙喝酒這些對健康有極大損害的事情也沒辦法完全戒掉,能有超前癌癥的預防和風險管理的意識的人就更稀少了。
不過,國內的基因檢測服務已經開始日益成熟起來。尤其現在google,BAT等大型互聯網機構也開始涉足基因領域,很多保險公司也開始與基因檢測機構有合作的產品推出。隨著更多資金的投入,相信會有更多人能夠了解基因檢測,也會有更多人樂于去了解自己的遺傳背景,畢竟癌癥現在還是頭號的殺手,能多了解一點有什么不好的呢?
再補充一句,個人十分看好互聯網(恐怖的流量)+ 基因檢測(精確的技術、解讀) + 保險服務(風險管理)+ 線下醫院服務這樣的合作模式。智能手機只用了幾年時間就徹底改變了我們的生活方式,這種多方聯合的健康管理模式我覺得也有機會再次改變我們的生存模式。這中間需要探索的地方還有很多,然而可供想象的空間也極大。
以上。
首先要明確的一點是,癌癥的發病機理是十分復雜的。衣食住行方方面面都會對腫瘤的形成做出貢獻。以研究的比較多的乳腺癌為例,與發病率顯著相關的包括以下幾點:
這些風險中的“有乳腺癌家族史”這一項,有很大一部分就是遺傳的風險,也就是“基因”導致的患病風險。
要說明基因檢測是否能有效預測癌癥的患病風險,首先就要知道癌癥與基因到底有什么關系。
首先,癌癥與區別于其他疾病最重要的一點,就是它是一個“基因病”,幾乎所有癌細胞中都能找到明顯的基因突變。得益于測序費用的降低,最近幾年積累了大量的癌癥基因組的數據。比如TheCancerGenomeAtlas?Research?Network, TCGA,目前針對常見的癌癥都作了大規模的癌組織/正常組織的對比分析,數據包括基因組、轉錄組等各個組學,來看下乳腺癌的突變情況:
引用自:Comprehensive molecular portraits of human breast tumours, doi:10.1038/nature11412
為何癌癥基因組與正常組織差距如此之大?
現在主流的觀點,癌癥的發展和達爾文的進化論有很大的相似之處。癌細胞不斷的分裂過程中,基因組也在不斷的變異,有更高的生存優勢的細胞接積累的越多。
Wellcome Trust Sanger Institute在他們的一篇乳腺癌論文中,通過超高深度的全基因組測序,發現乳腺癌的發展并不是一蹴而就的,而是通過不斷的基因突變的積累,乳腺才從完全正常的組織,一步步發展成高度復雜的,有多種癌細胞亞克隆群體的癌組織。在這一過程中,在最早的祖先癌細胞出現前,乳腺細胞就已經有了驅動癌癥發生的突變,如PIK3CA,TP53,ERBB2,?MYC,?CCND1等。這些腫瘤驅動基因的突變(driver gene mutation),會大大增加乳腺癌的患病風險。 (話說當年看到這個paper真是佩服的一塌糊涂,單個樣本高深度測序就能把這么復雜的過程給推測出來了,媽媽問我為什么跪著看論文……)
所以驅動突變的出現,就相當于朝著癌癥邁進了一小步。而很多驅動突變,都是在被稱之為
腫瘤抑制基因(tumor suppressor gene)和原癌基因(oncogene)上的。比如在乳腺癌的風險基因中,最常被提及的BRCA1及BRCA2,都是腫瘤抑制基因。它們的主要功能是參與DNA損傷修復,和維持基因組的穩定性。如果這兩個基因發生影響其功能的變異,則腫瘤驅動基因的突變出現的時候難以被有效的修復,乳腺細胞癌化的可能性就會大大增加,甚至也會增加其他癌癥的風險。
所以,基因和腫瘤有沒有關系?答案很明顯,有關系,而且還不小。
如題主所說,目前市場上已經開始出現很多基因檢測來預測癌癥風險的產品了,有類似安吉麗娜·朱莉那樣的測完整的BRCA1/BRCA2的基因來推測乳腺癌風險的,也有檢測一堆多態性(SNP)位點,來評估相對風險的。
這些檢測,靠譜嗎?
我個人的判斷是,大部分的這類檢測至少都是有一定科學依據的。在癌癥的研究方面,我們積累的數據量已經很多很多了,大部分的癌癥都做過易感性的研究,結合這幾年測序技術在癌癥領域的應用,高頻率的driver gene mutation也找的差不多了。所以參與這些檢測,如果真的檢測結果是高風險的話,受檢測者確實需要多警惕,注意進行恰當的癌癥風險管理。
比如像朱莉那樣,BRCA1/BRCA2上發現純合且顯著改變基因功能的突變,可能終生的患病風險能到80%以上。這樣的情況下,切除乳腺組織就是非常理性的選擇。而且市面上已經出現了降低得乳腺癌的風險的藥物,如他莫昔芬,雷洛昔芬等。就算不手術,不服藥,單純的增加體檢頻率,早起發現癌癥的話也能極大提高患者的5年生存率。
現在回到題主的問題上來,為什么國內的群眾大多不認可或者是覺得沒有必要呢?
我覺得主要有以下幾點:
1. 最重要的一點,是大家對基因檢測的不了解。不做基因這塊領域的,對基因是什么基本沒有比較清晰的概念,大家最能說得上來的可能是“克隆”、“轉基因”之類的概念。不是聽起來像魔法,就是在輿論中被妖魔化了。而真正做這塊的,也大部分在科研醫療機構,對民眾的宣傳科普的工作做得并不好。
2. 第二點,是基因檢測推斷癌癥風險并不能完美預報個體的患病風險。不像單基因病,突變ó得病幾乎是完全對應的關系,基因、遺傳并不是導致癌癥的唯一因素。乳腺癌為例,大概只有10%的乳腺癌是可以確切證明是由遺傳導致的。剩下的90%?基因檢測發現不了這些風險。而且限于成本,目前B2C市場的大多數檢測產品,都是對少部分基因、位點的檢測,不可能覆蓋全基因組的解讀。
3. 第三點,是沒有很好的風險管理的辦法。雖然NCCN發布過《breast cancer risk reduction》、《genetic/Familial high-risk assessment:Breast cancer and pvarian》等指導性的風險評估和降低風險的指南,但是國內有條件,而且有意愿按照指南健康管理的機構并不常見。對于普羅大眾,抽煙喝酒這些對健康有極大損害的事情也沒辦法完全戒掉,能有超前癌癥的預防和風險管理的意識的人就更稀少了。
不過,國內的基因檢測服務已經開始日益成熟起來。尤其現在google,BAT等大型互聯網機構也開始涉足基因領域,很多保險公司也開始與基因檢測機構有合作的產品推出。隨著更多資金的投入,相信會有更多人能夠了解基因檢測,也會有更多人樂于去了解自己的遺傳背景,畢竟癌癥現在還是頭號的殺手,能多了解一點有什么不好的呢?
再補充一句,個人十分看好互聯網(恐怖的流量)+ 基因檢測(精確的技術、解讀) + 保險服務(風險管理)+ 線下醫院服務這樣的合作模式。智能手機只用了幾年時間就徹底改變了我們的生活方式,這種多方聯合的健康管理模式我覺得也有機會再次改變我們的生存模式。這中間需要探索的地方還有很多,然而可供想象的空間也極大。
以上。
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現在從基礎研究的層面來看,我們對癌癥的了解還太少。我也參加過一些腫瘤基因組的項目,項目的成果最后也都發表在了很不錯的學術期刊上。但我覺得,在各個研究項目中發現的新突變和新的跟某種腫瘤有關的基因,都只是反映了我們對癌癥的機理還沒有一個正確的認識方法。
不過,畢竟已經積累了不少數據,根據這些數據得到的統計結果和一些局部的認識。現在的腫瘤風險評估,乃至早篩和個性化治療都是基于這些零碎的知識。固然已經能解決一些問題,極大的提高了生存期,但人類對癌癥的全面征服還有很長的路要走。
謝謝樓主的帖子
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WeGene當前的復雜疾病檢測項目盡量努力的往科研,往參考數據整理方面去做,而不是給任何的意見。我想,幫助普通人把科研項目結果整理并翻譯出來,通過數字羅列和顯示,這也可以是一個很有價值的事情,并不需要我們告訴用戶有什么風險有什么概率。
讓用戶用高性價比獲得基因數據,幫用戶整理和翻譯科學文獻內容,這是我們現在的產品設計目的。
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