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Mehmet Mehmet - R1b-Z2106-CTS8966 綜合討論組

追蹤武漢新型冠狀病毒2019-nCov 的基因秘密,來看看自己的ACE2基因什么情況!

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疫疾無情,人間有情。武漢肺炎疫情形勢嚴峻,在全國范圍內,不僅僅是醫護工作者在前線戰斗,廣大的科研工作者也在爭分多秒地對2019-nCoV進行研究,希望盡快從根本上了解這一病毒并尋找戰勝它的方法。
近日,同濟大學附屬東方醫院的左為團隊在?bioRxiv?上在線發表了一篇論文 Single-cell RNA expression profiling of ACE2,the putative receptor of Wuhan 2019-nCoV

該研究通過單細胞測序RNA-Seq技術發現:武漢新冠病毒(2019-nCoV)的受體ACE2在亞洲男性肺泡細胞中高表達!換句話說,僅從病毒受體方面分析,亞裔人群可能更容易感染武漢新冠病毒,尤其是亞裔男性。

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2019年12月,武漢華南海鮮市場爆發不明原因肺炎,經過病原體分離診斷及二代測序分析,該不明原因肺炎是由一種新型冠狀病毒(2019-nCoV)引起的。值得注意的是,2019-nCoV與SARS-CoV具有較高同源性,后續研究也證實兩種病毒通過相同的受體入侵人體——血管緊張素轉換酶2 (ACE2)

目前的統計數據表明2019-nCoV感染患者大多為亞裔男性,雖然這與病毒爆發的地區密切相關,但是2019-nCoV的受體ACE2作為一種基因的表達產物,是否在不同性別以及不同族裔人群中存在表達差異性,從而影響2019-nCoV乃至類似冠狀病毒的易感性呢?在本研究中,研究人員通過單細胞RNA-Seq技術證實這一猜想。
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圖為2019-nCoV的S-蛋白與人ACE2結合的預測模型

2019-nCoV的嚴重感染可導致急性呼吸窘迫綜合征(ARDS)和敗血癥,最終導致患者死亡。先前的研究表明,2019-nCoV與人呼吸道接觸后,病毒的刺突蛋白(spike protein)便與敏感細胞的表面受體ACE2結合,后者介導病毒進入靶細胞以進一步復制。盡管2019-nCoV與ACE2的結合強度弱于SARS-CoV,但仍遠高于病毒感染所需的閾值。

受體的表達和分布決定了病毒感染的途徑,而感染的途徑對于理解發病機理和設計治療策略具有重要意義。有研究表明ACE2主要在Ⅰ型和Ⅱ型肺泡上皮細胞(AT1和AT2)中表達。因此,研究者對在線數據庫中的8名正常的肺移植捐獻者的肺組織進行了單細胞RNA測序技術(scRNA-Seq)。他們分析了43134個細胞,并進行了聚類分析,又針對每個個體,基于標記基因而劃分為8-11個不同的細胞簇。
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緊接著,研究者分析了ACE2在每個個體中的細胞類型特異性表達模式。對于所有供體,ACE2在所有人肺細胞中的表達率為0.64%,大多數ACE2表達細胞(平均83%)是AT2細胞(平均1.4±0.4%的AT2細胞表達ACE2)。其他表達ACE2的細胞類型包括AT1細胞、氣道上皮細胞、成纖維細胞、內皮細胞和巨噬細胞。然而,它們表達ACE2的細胞比率較低,且在個體間存在差異。

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為了進一步了解表達ACE2的AT2特殊細胞群,研究者進行了基因本體富集分析,通過與不表達ACE2的AT2細胞進行比較,從而研究哪些生物學過程與該細胞群體有關。令人驚訝的是,多個病毒過程相關的生物學過程與之存在聯系,包括“病毒過程的正向調節”(P值=0.001)、“病毒生命周期”(P值=0.005)、“病毒組裝”(P值=0.03)以及“病毒基因組復制的正調節”(P值=0.04)。在ACE2表達的AT2中高度表達的病毒過程相關基因包括:SLC1A5、 CXADR和CAV2等34個基因。因此,2019-nCov似乎已經極其巧妙地進化到劫持AT2這一細胞群體,以便其復制和傳播。
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研究者進一步探究了供體特征及其ACE2的表達模式的關聯性,但未檢測到ACE2表達細胞數與捐獻者年齡或吸煙狀況之間的關聯。

然而值得注意的是,2名男性供者的ACE2表達細胞比例高于其他6名女性供者(1.66% vs. 0.41%)。此外,ACE2在男性供者中的分布也比女性更廣泛:男性肺中至少有5種不同類型的細胞表達ACE2受體,而女性肺中僅有2~4種。這一結果與疫情調查結果高度一致,調查顯示,確診的2019-nCov感染患者大多為男性。

研究人員還注意到,唯一的亞洲供體(男性)的ACE2表達細胞比率遠高于白人和非裔美國人的供體(2.50% vs. 0.47% of all cells)。這也許可以解釋為什么2019-nCoV大流行以及SARS-CoV大流行都集中在亞洲地區。

總而言之,該研究通過單細胞RNA測序技術以單細胞分辨率報道了ACE2在人肺中的RNA表達譜,并經過統計分析表明ACE2受體與性別和族裔相關。客觀解釋了當前2019-nCoV男性感染患者較多的臨床統計數據,同時也解釋了2019-nCoV在亞洲地區大流行的生物學原因。值得一提的是,該研究分析的樣品過少,仍有待進一步研究確認。
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以下是我幾個樣本的ACE2基因型:

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2020-02-01 ? IP屬地南京
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zwh123 - 湖南洞口張姓
這篇文章是赤裸裸的昧著良心為了宣傳基因助手消費沒有基本鑒別能力吸引眼球的文章,實際上受檢測的亞洲男性才一例,而且并沒有寫明到底是東亞裔、西亞裔、南亞裔、東南亞裔還是中亞裔,作者有可能故意隱瞞,也可能并不知道是哪個地區的亞裔,這些地區中大部分和中國人有者不同的人種,可以說論文就是來娛樂大眾的,并非想有結論,一個不知道何來源的樣本就拿出來炒作,是毫不嚴謹的,沒有科研精神的!
rs2106809,rs2285666,我看也基本就這兩個人和人之間會有差異,其他都一樣啊。那么說了這么多,具體到每個,哪種組合才是危險,哪種是低風險?
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我也是這個,這是容易得還是不容易
怎么測?

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