
有人看了WEGENE最新出的論文嗎?
由于是英文版,我英語不大好。
為什么這圖2的CD兩張圖會不一樣。
The most populated 1st-level?(a), 2nd-level?(b), and 3rd-level?(c)?cluster in each prefecture.?d.?The 3rd-level cluster with the largest odds ratio in each prefecture.?e.?The spatial distribution of the 3rd-level subclusters in Jiangsu province is accompanying the linguistic-cultural division. The most populated clusters were shown.?f.?Three major clans in Guangdong, Canton, Hakka (falling into two clusters), and Min-Chaoshan, can be distinguished from the haplotype network clusters. The clusters with the largest odds ratio were shown.?g-h.?The paths of the?Zou Xikou?(g)?and?Chuang Guandong?(h)?migration waves. In panels?a-d, 50% transparency was applied to the prefectures with small sample sizes (n < 10), and prefectures with no valid samples were left blank.
按論文描述圖C應(yīng)該是以“三級”分類prefecture我理解為地級市,占比最大的做的圖。
可是圖D確在細節(jié)處有很大的不同,比如膠東地區(qū),福建。
在二級分類的情況下,贛州漢與東南的閩客浙南一組,但繼續(xù)細分,三級下贛州和中南組歸為一類圖C,但圖D又歸入珠江流域的客家組。
還沒完,繼續(xù)細分,四級分類下,贛州與梅州龍巖汕尾聚成一組,脫離珠江流域的客家組。
還有論文給出了閩粵三個族群與二級下的北方組的關(guān)系,卻沒有給出閩粵與華中和華東和西南組的關(guān)系。我想知道鄰近的中南組合和二級下的華北組IBDshareing能透露一下嗎。
有微基因的大佬知道原因嗎?
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從圖上看,贛州這個地方最大的組團依然應(yīng)該是兩湖江西的主力(在江西是江右民系),而最具代表性的組團卻是(疑似)客家。類似地在廣東,在廣、客、潮交接的地方,也會出現(xiàn)「最大」與「最具特點」的組團不同的情況
?
用odds ratio有時候可以看到更精細的地域分布特點,比如膠東半島和東北共享同一個最具代表性的組團,可能暗示了「闖關(guān)東」移民(尤其是經(jīng)水路的移民)和闖關(guān)東出發(fā)點——膠東半島的近代遺傳關(guān)聯(lián)
?
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論文doi: https://doi.org/10.1101/2020.07.03.166413
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