
發(fā)現(xiàn)一個(gè)目前點(diǎn)位利用率與檢測(cè)點(diǎn)位數(shù)最高的常染色體計(jì)算器
Eurogenes K14? ? ? ? ? ?
處理完原始常染文件后,點(diǎn)位利用率96%,檢測(cè)點(diǎn)位數(shù)接近20萬(wàn),對(duì)于東亞、東亞南部、西伯利亞、歐洲、中東區(qū)分非常細(xì)致。
?
??????? 14 ancestral populations
??? 202404 total SNPs????????????? 檢測(cè)點(diǎn)位
??????? 42 flipped SNPs
???? 56480 heterozygous SNPs
????? 3943 no-calls
????? 3366 absent SNPs
? 0.963889 genotype rate?????????? 點(diǎn)位利用率
????? mode genomewide
?
?
?
?----------------------------
?FINAL ADMIXTURE PROPORTIONS:
?----------------------------
?
? 0.43%? Northeast_Euro????? 東歐
? 0.15%? Sub-Saharan???????? 撒哈拉沙漠以南非洲??????
? 0.00%? Berber???????????? 北非伯伯爾人
? 0.02%? South_Asian???????? 南亞印度
??1.15%? West_Euro????????? 西歐
?59.18%? Southeast_Asian???? ?東亞南部
? 0.23%? South_Siberian????? ?西伯利亞南部
? 0.01%? North_Asian???????? 北亞
? 0.36%? East_Siberian?????? ?西伯利亞?wèn)|部
?38.47%? East_Asian????????? 東亞
? 0.00%? East_Mediterranean? ?地中海
? 0.00%? Middle_Eastern????? ?中東
? 0.01%? West_Asian????????? 西亞
? 0.00%? Volga-Ural????????? ?伏爾加-烏拉爾
?
???? CPU time =? 162.42 sec
[1] 0
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? 0.23%? South_Siberian????? ?西伯利亞南部
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? 0.00%? Middle_Eastern????? ?中東
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