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yhlhhhhh yhlhhhhh - 每日與生物工程斗智斗勇到謝頂 祖源分析

直接利用G25坐標畫出PCA散點圖

編程語言:python3.x
模塊:
numpy
sklearn
matplotlib
可選:
jupyter notebook
整體思路:將G25給出的25維坐標降維并畫圖
二維PCA散點圖
代碼如下圖所示:

截屏2021-06-14_下午2.36_.04_.png

?
1. 先把自己手中的G25坐標數據集整理成csv
2. 讀取csv文件(此處我直接用的numpy模塊讀取,用csv模塊或pandas也可)
3. 將讀取的數組利用sklearn降維(此處的n_components表示降維后的維度,既然是二維圖,所以是2)
4. 用matplotlib模塊畫散點圖
展示結果:

截屏2021-06-14_下午2.37_.33_.png

?
三維PCA散點圖
步驟與二維類似,只是需要把n_components改成3,然后matplotlib部分需要畫三維圖
展示結果:

截屏2021-06-14_下午2.52_.30_.png

?
(代碼我已經放在附件里,大家可以下載使用)
2021-06-14 ? IP屬地北京
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yhlhhhhh - 每日與生物工程斗智斗勇到謝頂
我把這個帖子寫到CSDN上了,上面還有怎么看降維后坐標,有興趣的可以看看:
我用#CSDN#這個app發現了有技術含量的博客,小伙伴們求同去《利用G25祖源計算器坐標畫PCA散點圖》, 一起來圍觀吧 https://blog.csdn.net/yhlhhhhh/article/details/117919392?utm_source=app&app_version=4.9.0&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen
太優秀了
yhlhhhhh - 每日與生物工程斗智斗勇到謝頂
另外記得,如果電腦上沒有python一定要下python,記得下pip包管理工具,然后安裝模塊。
安裝模塊方法:
1. windows系統:打開命令行工具 ? ? Mac:打開終端
2.在里面輸入以下命令:
pip3 install numpy
pip3 install sklearn
pip3 install matplotlib
如果安裝模塊過程中下載速度很慢:
輸入以下命令:
pip3 install numpy -i?https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
pip3 install sklearn -i?https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
pip3 install matplotlib -i?https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
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west - 早知道基因,早做健康管理哈
竟然還提供代碼??
厲害了
技術貼

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