科普：Fst，群體間分化指數(shù)，用于群體間分化分析。
取值范圍：[0, 1]
劃分標(biāo)準(zhǔn)：
0～0.05:群體間遺傳分化很小，可以不考慮；
0.05～0.15，群體間存在中等程度的遺傳分化；
0.15~0.25，群體間遺傳分化較大；
0.25以上，群體間有很大的遺傳分化。
在這里，我們以三種計算器：K3，K12b，K47分別代表k數(shù)小、中、大的計算器來進(jìn)行研究
計算方法：https://blog.csdn.net/q623928815/article/details/78627610?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522163905592216780357252120%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334.pc%255Fall.%2522%257D&request_id=163905592216780357252120&biz_id=0&utm_medium=distribute.pc_search_result.none-task-blog-2~all~first_rank_ecpm_v1~rank_v31_ecpm-5-78627610.pc_search_result_cache&utm_term=%E7%BE%A4%E4%BD%93%E9%97%B4%E5%88%86%E5%8C%96%E6%8C%87%E6%95%B0&spm=1018.2226.3001.4187
Python代碼實(shí)現(xiàn)：


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三種計算器按照分類標(biāo)準(zhǔn)分類后折線圖：


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得出結(jié)論：
Fst中等及以上位點(diǎn)數(shù)越多計算器越準(zhǔn)確，注意是位點(diǎn)數(shù)而不是占比。而且說明計算器位點(diǎn)數(shù)對于穩(wěn)定性的影響可能是大于Fst值各部分占比對穩(wěn)定性的影響，所以說明篩選計算器位點(diǎn)的時候可以適當(dāng)放寬Fst標(biāo)準(zhǔn)然后增加位點(diǎn)數(shù)。
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p.s.：
這三個計算器單個位點(diǎn)Fst值對應(yīng)情況在附件中，可供大家下載。

• Fst.zip