
【基因助手】2022年4月更新,父系,母系單倍群多樣性分布!
基因助手
https://geneu.xyz
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先說明幾個概念,
生物多樣性,是生物及其環境形成的生態復合體以及與此相關的各種生態過程的綜合,包括動物、植物、微生物和它們所擁有的基因以及它們與其生存環境形成的復雜的生態系統。
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奠基者效應指一族群最初只由少數個體由他處播遷至某地而建立,經一段時間之繁衍,雖個體數增加,但整個族群遺傳多樣性卻未有提高。
基因漂變指的是族群中等位基因頻率在每一個世代之間的隨機的變化。這種變化能夠以數學表達,哈蒂-溫伯格平衡描述了理想狀態情況下(不考慮天擇等因素)的數學模型。在理想狀態中,后代的等位基因頻率將接近隨機分布。當族群規模較大,基因漂變的機率會較低;當族群規模較小的時候,基因漂變的現象較為明顯。
當一個新的群體只由幾個個體建立起來時,就發生了隨機漂變的極端情況,即稱為奠基者效應,在海島生活的許多物種的群體,盡管已有幾百萬個個體組成,但它們往往都是很久以前偶然到來的一個或幾個移居者的后裔。湖泊、隔離的森林和生境中也有這種情況。如果這幾個移居者之間在某些基因座上的基因頻率的差別,大于這幾個移居者本來所屬群體之間的差別,則將對這些移居者后裔的進化產生持久的重大影響。
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目前的單倍群樣本分布圖,會存在奠基者效應和家族相關性樣本的影響,無法體現真實的單倍群多樣性。通過測算YFull全網用戶、FTDNA全網用戶、WeGene授權用戶的父系Y和母系mt單倍群的分化距離,并識別奠基者效應、家族相關性樣本的影響,采用熱力圖形式,描繪出了任意父系Y和母系mt單倍群的多樣性,對于多樣性高的地區,也有較高的可能性是此單倍群的發源地。
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以下是主要父系Y和母系mt單倍群的多樣性分布熱力圖,支持地圖模式和衛星模式,也可查詢任意單倍群的多樣性。所有數據都定期更新。
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生物多樣性,是生物及其環境形成的生態復合體以及與此相關的各種生態過程的綜合,包括動物、植物、微生物和它們所擁有的基因以及它們與其生存環境形成的復雜的生態系統。
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奠基者效應指一族群最初只由少數個體由他處播遷至某地而建立,經一段時間之繁衍,雖個體數增加,但整個族群遺傳多樣性卻未有提高。
基因漂變指的是族群中等位基因頻率在每一個世代之間的隨機的變化。這種變化能夠以數學表達,哈蒂-溫伯格平衡描述了理想狀態情況下(不考慮天擇等因素)的數學模型。在理想狀態中,后代的等位基因頻率將接近隨機分布。當族群規模較大,基因漂變的機率會較低;當族群規模較小的時候,基因漂變的現象較為明顯。
當一個新的群體只由幾個個體建立起來時,就發生了隨機漂變的極端情況,即稱為奠基者效應,在海島生活的許多物種的群體,盡管已有幾百萬個個體組成,但它們往往都是很久以前偶然到來的一個或幾個移居者的后裔。湖泊、隔離的森林和生境中也有這種情況。如果這幾個移居者之間在某些基因座上的基因頻率的差別,大于這幾個移居者本來所屬群體之間的差別,則將對這些移居者后裔的進化產生持久的重大影響。
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目前的單倍群樣本分布圖,會存在奠基者效應和家族相關性樣本的影響,無法體現真實的單倍群多樣性。通過測算YFull全網用戶、FTDNA全網用戶、WeGene授權用戶的父系Y和母系mt單倍群的分化距離,并識別奠基者效應、家族相關性樣本的影響,采用熱力圖形式,描繪出了任意父系Y和母系mt單倍群的多樣性,對于多樣性高的地區,也有較高的可能性是此單倍群的發源地。
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贊同來自: 鄭肇偉
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