基因助手
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2022年7月更新：您已經(jīng)檢測(cè)過(guò)基因了？想知道自己在全球基因公司的父系/母系樹(shù)上的結(jié)果嗎？全球五家基因公司父系/母系樹(shù)形更新，供您探索 DIY！

首頁(yè) -> 祖源探索：
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1，父系/母系單倍群分型，特性如下：

• 支持所有基因公司的Microarray芯片格式數(shù)據(jù)（TXT文本文件，有rsid, chr, position, genotype四列），其中position坐標(biāo)支持hg19或hg38格式，不挑剔數(shù)據(jù)質(zhì)量。微基因用戶可下載自己的基因原始數(shù)據(jù)：http://www.sofreetech.com/account/setting/profile/#!download? 其他公司的用戶可自行聯(lián)系其客服獲取基因數(shù)據(jù)文件。
• 統(tǒng)計(jì)您DNA數(shù)據(jù)中22條常染色體，XY性染色體，mt線粒體的SNP位點(diǎn)數(shù)、indel插入缺失數(shù)、no-call未檢測(cè)數(shù)、祖源成分的用戶和標(biāo)桿人群的數(shù)據(jù)利用率。
• 分型采用全球主流基因公司的最新版Y-DNA和mtDNA樹(shù)形，且定期同步更新，截止2022.7.1，?ISOGG（2019-2020 v15.73，10,265個(gè)Y單倍群）、YFull（v10.03.00，41,363個(gè)Y單倍群）、FTDNA（myOrigin v3.0，56,778個(gè)Y單倍群）。未來(lái)可擴(kuò)展支持更多基因公司的父系/母系單倍群樹(shù)。
• 分型策略可選擇：保守型（只接受連續(xù)突變）、平衡型（有條件的接受非連續(xù)突變）、激進(jìn)型（接受所有非連續(xù)突變）
• 分型結(jié)果按照總突變數(shù)、可信度排序，提供Top5 分型結(jié)果和SNP突變?cè)斍椋脩艨勺孕胁榭捶中徒Y(jié)果路徑中每個(gè) SNP 位點(diǎn)是否 derived派生型（深綠色），或ancestral祖先型（淺綠色），或未檢測(cè)位點(diǎn)（半透明色）。

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2，祖源成分計(jì)算，目前提供三個(gè)標(biāo)桿人群：適合中國(guó)人群的E11標(biāo)桿、適合中西亞人群的 Turkic K11標(biāo)桿、適合全球族群的 World K47標(biāo)桿。未來(lái)視服務(wù)器資源，可擴(kuò)展提供更多標(biāo)桿人群。
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3，性能情況

• 用戶DNA數(shù)據(jù)文件上傳，文件越大越耗時(shí)，用戶網(wǎng)絡(luò)越慢越耗時(shí)，10~30M的數(shù)據(jù)文件，約3~10秒上傳完成。
• 父系/母系分型，計(jì)算耗時(shí)取決于選擇的單倍群樹(shù)形，單倍群樹(shù)的SNP越多越耗時(shí)，ISOGG (約1分鐘) < YFull (約1~2分鐘)?< FTDNA?(約3~4分鐘) 。?
• 民族祖源成分，計(jì)算耗時(shí)取決于選擇的標(biāo)桿人群，標(biāo)桿人群數(shù)據(jù)量越大越耗時(shí)， E11?(約1分鐘) < Turkic K11?(約1分鐘) < World K47?(約3分鐘)。?

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以上計(jì)算采用多線程并發(fā)任務(wù)，總耗時(shí)約1~4分鐘，請(qǐng)耐心等待，喝杯咖啡，不要中途刷新或關(guān)閉頁(yè)面。歡迎體驗(yàn)！