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商冠東
綜合討論組
8206 個(gè)討論
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1. 用千人基因組的數(shù)據(jù),選擇自己感興趣的人群,構(gòu)建一個(gè)訓(xùn)練數(shù)據(jù)集,用Admixure軟件做一個(gè)自己的祖源成分分析;這個(gè)過程中你會(huì)熟悉千人基因組數(shù)據(jù)集,如何處理NGS的VCF文件,如何抽取和組合數(shù)據(jù),如何使用Admixture軟件等等。
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2. 用Clinvar數(shù)據(jù)庫注釋你自己的所有SNP。這個(gè)過程你需要自己寫一些腳本,熟悉Clinvar數(shù)據(jù)庫,知道各種突變的描述方式,知道疾病相關(guān)位點(diǎn)的分類和表達(dá)方式等等。
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。。。
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最近發(fā)現(xiàn)一本書,叫exploering peronal genomics,序言是Church大神寫的,專門教你怎么玩?zhèn)€人基因組數(shù)據(jù),可以看看。
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如果全部折騰明白了,請(qǐng)發(fā)簡歷給我,[email protected]
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