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馬豐收 馬豐收 - 突然就通風了呢 建議和反饋

為什么有很多位點未檢出?


比如頭發(fā)卷曲還是直,rs1454292 rs3124314 rs6732426 rs7349332這些位點未檢出,一共7個,只檢出3個,給出了直發(fā)的結果。
但是我明顯是卷發(fā)。
還有很多位點同樣未檢出。希望報告能給出一個檢出的比例。
2016-01-29 ? IP屬地濟南
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zhengqiang - 勤奮學習
1,我們解讀數(shù)據(jù)庫和芯片設計是分開的,解讀數(shù)據(jù)庫不斷在更新,所以導致部分更新的數(shù)據(jù)不一定在我們芯片上。
2,確實我們芯片也有未檢測率,一般來說call rate基本上都是在99%以上。
3,部分SNPs在芯片上無法檢出。
@馬豐收 頭發(fā)卷曲選用的位點全是基于歐洲人群的研究結果,對東亞人的區(qū)分度不是很好。接下來我們得進行大量的問卷調(diào)查,結合其全基因組芯片數(shù)據(jù),分析符合東亞人群的位點,使預測更加準確。
馬豐收 - 突然就通風了呢
卷發(fā)照片

卷發(fā).jpg

?
另外,除了頭發(fā)卷曲,還有黃色深紅色頭發(fā),應該是遺傳自我母親一方。我母親的兄弟姐妹都是頭發(fā)都偏黃,高鼻梁,瞳孔的顏色也偏黃。聽我媽說老爺?shù)母赣H從西北逃難來到山東。
wang - 哈佛醫(yī)學院、德國馬普所分子人類學博士后
求樓主貼照片,看下頭發(fā)卷曲程度~
我個人理解的是:一些位點來源文獻的解讀和數(shù)據(jù)庫,可能不在芯片設計上,另外可能就是在檢測時未能對應上,所以顯示未檢出,不過考慮到可能不影響中國人群結果的判斷和解讀,以及所占比重可能不大的情況下,在未檢出該部分位點的情況下,也可以生成報告,而至于卷發(fā)和直發(fā)的判斷,比較直觀,很多因素可能會影響到判斷。
馬豐收 - 突然就通風了呢
看到什么值得買上面有人曬單 同樣也是卷發(fā)測出來是直發(fā)
http://test.smzdm.com/pingce/p/28962/
未檢測和沒測這位點應該區(qū)分
根據(jù)下載數(shù)據(jù)來看,我的未檢出位點有7025個,總位點數(shù)596744,未檢出率大概1.18%。 這是不是有點高了?

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