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Mehmet Mehmet - R1b-Z2106-CTS8966 綜合討論組

【基因助手】2025年清明時節更新,支持 David Reich 的AADR古人DNA,1240k高通量測序,共17629個古人+現代人

哈佛大學的 David Reich 實驗室發布的Allen Ancient DNA Resource (AADR) 是目前比較全面的古人DNA數據,目前最新版本是v62。Reich團隊對全球公開發布的古人類樣本(全部采用shotgun測序和溶液內靶點捕獲技術,使用1240K探針捕獲分型)的原始數據BAM或FASTQ進行重新分析,并基于YFull單倍群樹分析了古人類的父系和母系。目前共有 17629 個樣本,其中包含?13571?個古人和 4058 個現代人。
Growth_in_world’s_published_human_genome-wide_ancient_DNA_data.png


基因助手本次升級:
1,引入AADR v62全部 17629 個樣本數據。
2,在“古人基因”(https://geneu.xyz/ancient)?,可按Y或mt單倍群、國家、族群搜索古人,例如:在族群輸入Xinjiang,顯示所有中國新疆古人;輸入Yamnaya,顯示所有顏那亞古人;輸入Viking,顯示所有維京古人;輸入BellBeaker,顯示所有歐洲鐘杯文化古人;輸入CordedWare,顯示所有歐洲繩紋器文化古人;輸入Maikop,顯示所有邁科普文化古人;輸入Sintashta,顯示所有辛塔什塔文化古人;輸入Afanasievo,顯示所有阿凡納謝沃文化古人;輸入Scythian,顯示所有斯基泰古人;輸入Mayan,顯示所有瑪雅古人。。。輸入不區分大小寫
微信截圖_20250404042054.png

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3,點擊“古人名稱”,顯示古人詳情信息,同時顯示古人的Y或mt單倍群的地理分布。
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4,在“單倍群搜索”(https://geneu.xyz/haplo-query),對于YFull單倍群,可在YFull樹上顯示古人(和YFull樣本、名人并列顯示)、顯示YFull單倍群下所有古人的地理分布(可選是否包含下游單倍群)
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基因助手古人基因入口:https://geneu.xyz/ancient
2025-04-04 ? IP屬地新加坡
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哈佛有檢測中國古人嗎

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