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【更新日志】來自更新菌的禮物—— 1000 萬個新的位點結(jié)果可以下載啦

大家好,暑假就快要過完了,不知道各位同學(xué)暑假作業(yè)都完成了嗎?下面更新菌要給大家做一道摸底小測驗:WeGene 為大家提供了多少位點的檢測結(jié)果呢?

恩,下面有一位同學(xué)答題了:“60 萬個!一張基因芯片大概能檢測幾十萬個位點!我去年暑假就下載過原始檢測數(shù)據(jù),大概也是這個數(shù)!”

更新菌我剛想打勾,我司的生物信息攻城獅看到了,趕忙說:“等等,這回答不完整,只能得一半分。從今天開始,在檢測的 60 萬個位點結(jié)果的基礎(chǔ)上,我們?yōu)榇蠹翌~外提供了?1000 萬個位點的數(shù)據(jù)下載啦!”

啊?從 60 萬到 1000 萬?這可有點嚇到我了。這多出來的位點是哪來的?生物信息攻城獅先給我出了道題——
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“小明和小黃是一起哈啤的好兄弟,小紅和小娜是一起逛街的好閨蜜。你在街上看到了小紅和一個人走在一起,TA是?”

“應(yīng)該是小娜吧,畢竟是好閨蜜……”

“沒錯!小紅和小娜總是結(jié)對出現(xiàn),看到小紅,就知道小娜也不遠啦。其實遺傳學(xué)上也有類似的現(xiàn)象,許多基因位點之間的結(jié)果有很強的關(guān)聯(lián)關(guān)系。這種關(guān)系我們稱之為『連鎖不平衡』。基于這樣的原理,當(dāng)我們檢測到某些位點的基因型以后,可以用 TA 們來計算其他沒有檢測的位點的基因型到底是啥。當(dāng)然,實際情況可能要復(fù)雜一些,因為基因圈比較亂,通常我們會需要根據(jù)一堆位點的檢測結(jié)果去計算另一個位點,而不僅僅基于一個位點。”
?
“原來如此,那這么計算準(zhǔn)嗎?”
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“計算的準(zhǔn)確率暫時還做不到 100%。畢竟小紅說不定和小明談戀愛了呢(誤)?但是,根據(jù)我們特別設(shè)計的芯片位點、所采用的經(jīng)過了優(yōu)化的標(biāo)準(zhǔn)科研算法,在這基于 60 萬個檢測結(jié)果計算而得的 1000 萬個位點里,我們可以達到超過 98% 的準(zhǔn)確率。”

“你怎么知道能達到 98% 的準(zhǔn)確率?隨便吹牛可不行啊!”
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“忘了上次讓你嚇得瑟瑟發(fā)抖的 WeGene 集體抽(mai)血事件了?我們都做了全基因組的檢測,將實際檢測結(jié)果和計算結(jié)果一比對就知道啦。雖然這部分結(jié)果還不能用于臨床使用,畢竟準(zhǔn)確性還不到 100%。但去對更多的性狀和祖源進行分析、或者模擬個把不同格式的數(shù)據(jù)(像 23andme 神馬的)去第三方工具那邊分析都是沒啥問題的啦。
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好吧,算你狠……

那這 1000萬個數(shù)據(jù)位點結(jié)果從哪里下載呢?

簡單,進入 設(shè)置 - 賬號信息,找到您的綁定套件,并點擊 “擴展數(shù)據(jù)下載”。輸入您的密碼并點擊下載,我們會為您開始準(zhǔn)備數(shù)據(jù)。準(zhǔn)備數(shù)據(jù)完成后(通常不會超過 1 小時,請求的用戶多時可能會稍稍慢一些),您會收到網(wǎng)站私信通知,再次點擊“擴展數(shù)據(jù)下載”鏈接輸入密碼即可進行下載。更新菌溫馨提醒:1000 萬個位點結(jié)果是很大的哦,不是壕的話,記得別用手機流量 ^^

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下載完成后,您只需要對文件進行解壓縮,即可得到您的位點結(jié)果啦。結(jié)果文件中包含相應(yīng)的位點編號、染色體位置及基因型結(jié)果。趕緊研究起來吧~

Have fun exploring the secret of life!
2017-08-29 ? IP屬地深圳
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21 個回復(fù)

@xraywu 我知道你的標(biāo)題說1000萬個新的位點,最好在正文里也醒目地告訴用戶,這1000萬個位點不包括測過的核心數(shù)據(jù)的位點
紫蔻 - 人類一思考,上帝就發(fā)笑
試了合并后的數(shù)據(jù)運行E11,結(jié)果和原來差不多
lfzyx - 咚咚鏘咚鏘
“小明和小黃是一起哈啤的好兄弟,小紅和小娜是一起逛街的好閨蜜。你在街上看到了小紅和一個人走在一起,TA是?”

“應(yīng)該是小娜的男朋友吧,畢竟是好閨蜜……”
cedre - -----------------------------------------------------------
第一時間頂
費力科思 - WeGene勤雜工
頂一下生物信息狗和IT狗的工作
AMD_Yes - Freedom is not free!
好消息!
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好耶~
為什么按要求下載,打開文檔顯示是亂碼啊
丁丁 - 干啥啥不行 學(xué)啥啥不會
生物盲下載了有用嗎?
Yamol - ~~~
從別的地方(如23andme)上傳的數(shù)據(jù)也可以變1000萬嗎?
為什么下載不了啊?好像被舉報了?
捕獲.PNG
為什么下載不了啊?好像被舉報了?
捕獲.PNG

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下載解壓后怎么什么都沒有
擴展數(shù)據(jù)跑的E11……
natsumi - 999用戶
純外行弱弱地問一下,這個數(shù)據(jù)位點一出,是不是之前很多微解讀的結(jié)果會變了?因為我之前有很多測試的結(jié)果是,該位點未測出。
tohozb - 萬里の臺風(fēng)
請問這1000萬的點位是否包括之前的60萬?
下載之后怎么看
GEDmatch提示不包含X-DNA :O
nkuzzt - No one
請問我剛做過檢測,結(jié)果還沒出來。這1000萬個點位的結(jié)果可以直接算出來么

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