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近視的SRY基因 祖源分析

我的mt是不是匹配錯了?

捕獲.PNG

如圖,目前wegene給出的是M71c,但從算法來講,還是M71a1a最有可能吧。151那里只有這一個位點供判斷,下游全是+,所以151假-或發(fā)生回復(fù)突變的可能性較大:反觀M71c那里只有1個點是+,不太靠譜。
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#圖里綠色的是+,灰色的是-,畫圈的是未檢測
2016-03-26 ? IP屬地中國
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2 個回復(fù)

wang - 哈佛醫(yī)學(xué)院、德國馬普所分子人類學(xué)博士后
沒有公認(rèn)的算法其實是因為mt譜系樹的構(gòu)建是基于已有樣本,跟據(jù)已有樣本的突變來摸索譜系上下游關(guān)系,但mt的特點是突變率較高,所以你會發(fā)現(xiàn)越到下游越復(fù)雜,有的情況下是只有一個樣本就能定義一個下游支系,那就可以理解為什么自己的突變和已有樹形不是完全匹配。
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你的情況更可能是M71a1a,因為T195C!是一個高變區(qū)位點,本身突變率就遠(yuǎn)高于編碼區(qū),所以很可能是你在M71a1a的基礎(chǔ)上自己又突變出了195這個位點。
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上述討論是基于數(shù)據(jù)完全正確的情況。也不排除你的195位點突變僅是數(shù)據(jù)質(zhì)量不佳造成的。
費力科思 - WeGene勤雜工
沒有公認(rèn)的算法,我們也在頭疼。
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我們正在做類似的,但交互性更好的Y和MT的可視化,讓用戶可以自己看到具體的匹配情況,以及我們的算法推薦的匹配路徑。

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