xraywu 綜合討論組

大家可以把自己的原始數據上傳到GEDmatch和SNPedia進行相應的分析啦~

先簡單介紹一下兩個網站——

GEDmatch.com?是一個利用基因組信息進行家系及親緣分析的網站。用戶可以上傳自己的基因組數據，與其他用戶上傳的數據進行比對，分析與他們的親緣遠近及發現未知的家系關系。
SNPedia?是一個開放的SNP位點維基百科。他們提供了一個叫做Promethease的服務。用戶可以上傳自己的基因組數據，SNPedia會根據他們已有的信息，分析用戶的基因特征，如疾病風險等。每次收費五美元。

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現在，他們都已經支持WeGene原始數據的導入啦！支持WeGene原始數據的導入啦！支持WeGene原始數據的導入啦！重要的事情說三遍。下面我們就來看看如何使用——
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GEDmatch.com

首先在我們的網站上下載你的原始數據：頁面右上角點擊`設置`-> `隱私`?-> `基因數據下載`。輸入密碼后下載文件。
因為目前我們提供的原始數據是純文本格式的，而GEDmatch只支持壓縮文件，你需要先把下載后的數據文件壓縮成.zip格式。?
到?GEDmatch.com?注冊一個賬號。
在網站首頁右側`File Uploads`里選第二項`WeGene upload`。填寫一下名字或昵稱，選擇相應的性別并同意數據進入公共數據庫。選擇相應的文件并點擊`Upload`。
上傳開始，因為速度較慢，注意不要反復點擊按鈕。因為他們服務器在國外，如果跳到了頁面加載失敗的頁面再重試。可以掛VPN后上傳。
上傳完成后，會轉到一個新頁面，不要關閉或刷新頁面，等待一段時間以后，頁面上會顯示一個標紅的ID（如M000000）。這份數據就上傳完成啦。回到首頁，你會發現在左下角`Your DNA Resources`里出現了該ID。
隔一段時間以后（通常是數小時），可以點擊`Analyze Your Data`里的`One-to-many?matches`工具查詢你的數據與其他用戶數據的遠近。在打開的頁面里輸入你的數據ID，選擇要用常染色體還是X染色體數據分析，點擊`Display`即可看到結果。結果里會給出親緣關系較近的用戶，其中`Gen`一列顯示你和他們之間隔了大約幾代。

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SNPedia/Promethease

與GEDmatch一樣，下載你的原始數據，無需壓縮。
去到Promethease首頁，點擊其中的`Upload Raw Data`上傳文件（較慢，同樣建議VPN）。
上傳完成后，點擊`Purchase for $5`，輸入一個有效的郵箱地址，然后付錢，支持支付寶哦。
付費完成后，數據就會開始分析。等一段時間后，可以在郵箱收到報告到Promethease網站查看。也可以在網站上下載。數據在網站上保留45天。
報告上主要會根據上傳的基因組數據判斷你的健康風險。

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有興趣的同學們可以嘗試起來啦，有任何問題歡迎報告~

2016-04-11 ? IP屬地加拿大

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王邵陽

同問，是上傳十幾兆核心數據還是兩百多兆的擴展數據

賣萌的12號染色體

謝謝樓主，讓我學到了不少好玩的東西。我做完了，把我的結果整理了一下，在知乎上發了個帖子（知乎上傳圖片更方便）。https://www.zhihu.com/question/28689086/answer/157724705?group_id=840123380505124864。如果大神有興趣看看，看到我有什么分析的不對的地方，請幫忙指出來。

贊同來自: xraywu 、AMD_Yes 、甘棠夭夭、mali2002 、加里dna 、huaiyi 更多 ?

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2017-04-25 ? IP屬地加拿大 ? 評論 (11)

懵懂的ASTN2基因

SNPedia上說，“WeGene?Chinese company with an East Asian population focus, but some data quality issues currently make it unreliable for use with Promethease.”
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是基因檢測數據有質量問題？
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來自頁面https://www.snpedia.com/index.php/Testing