ctlbj 祖源分析

Phasing是不是能使祖源成分分析更準確？

最近我在23andMe測了我孩子的DNA。當23andMe將我們的數據作了phasing以后，對我們的祖源成分分析進行了相當大的修改。據該公司講，phasing會提高祖源成分分析的準確性。WeGene也有計劃應用phasing嗎？

2016-04-11 ? IP屬地美國

按熱門排序按默認排序

5 個回復

費力科思 - WeGene勤雜工

Phasing有助于在算法層面讓組員成分分析更準，我們會朝這個方向去努力。計算量很大，對參考數據集也有要求。
?
現在，如傳超所說，現在起更大作用的是參考數據庫。WeGene現在用的也都是公開發表的樣本數據，文檔我們還在整理。暫時沒有用到古人類的數據。
?
東亞人群的古人類DNA數據幾乎木有，如果有合適的古代人基因組數據出來，我們應該會提供相關的分析并設計相關的產品。

ctlbj

謝謝！我對你們與顧客交流的透明度非常贊賞。

wang - 哈佛醫學院、德國馬普所分子人類學博士后

看祖源分析的尺度，當祖源分析要細化到中國各民族的時候，主要瓶頸就是人群近期混合所造成的“同質性”，也就說我們難以找出足夠的族群特異位點來進行非常精細的祖源識別，而這不是phase可以有效解決的。

wang - 哈佛醫學院、德國馬普所分子人類學博士后

另外，祖源分析的精準與否很大程度上取決于所使用的參考數據庫：
1. 如果參考數據只有現代人群，那么很難搞清楚誰是“源”誰是“流”；
2. 引入古代人群作為參考數據，可以在一定程度上幫助解決上述基因流向問題，使祖源辨析更準確。
?
23andme的參考數據庫并沒有涵蓋東亞人群，所以其祖源分析在東亞的解析度很低

ctlbj

你的說明意思，謝謝。WeGene現在用古人的樣本查“源”嗎？你說的“流”是指外來人群加入到原有的本地人群，還是指本地人群隨著時間有遺傳變異？DNA.LAND剛剛把他們的祖源成分分析細化了，還列出了每個分類的參考人群，好像都是公開發表的樣本。WeGene在參考人群的樣本上應比他們有優越的地方。是不是還在不斷地開發新的參考人群的樣本？

要回復問題請先登錄或注冊

亚洲精品午夜精品,日本二手网站,国产AⅤ爽AV久久久久成人社区,日本一二三区不收费av

Phasing是不是能使祖源成分分析更準確？

與內容相關的鏈接

5 個回復