Cccmm002 樂觀傾向

rs25531的結(jié)果是否可靠？

1. SNPedia上有這么一句：“23andMe reports that this genotype is not reliable on their platform. 23andMe users should ignore this result.”那么WeGene的如何？
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2. WeGene的報告中只有標(biāo)題一行，樂觀傾向。然而這一位點似乎大有研究，有很多研究結(jié)果，希望能盡快添加相關(guān)說明；
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3. SNPedia和OpenSNP上說的CC型是不是就是(-;-)型？

2016-04-15 ? IP屬地中國

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監(jiān)聽員1379

- 10級大佬 Dr. Z

目前微基因有三個關(guān)于這個位點的微解讀，
http://www.sofreetech.com/crowdsourcing/details/301
http://www.sofreetech.com/crowdsourcing/details/88??
http://www.sofreetech.com/crowdsourcing/details/378??
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結(jié)果都是CT比例特別低，不符合a^2：2ab：b^2的比例，而各大數(shù)據(jù)庫里測序的結(jié)果都應(yīng)該是CC最低，且符合a^2：2ab：b^2的比例。
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所以這個位點的微基因芯片結(jié)果大概率是有問題的。

陽光的NRG3基因

我從有記憶開始就是特別悲觀的人，可是基因顯示的是樂觀。

iamfred

我覺得我是矛盾體，我得了三次抑郁癥，但是我不抑郁的時候還挺樂觀的。。。

禮貌的DSCAM基因

SNPedia中的GG就是dbSNP中的CC，dbSNP中已經(jīng)明確標(biāo)注了REV（基因型是受位點提交組織確定的，“此位點位于minus鏈”，其實是提交組織用了ref的互補(bǔ)鏈作為參考并提交。為什么會出現(xiàn)這種情況呢？只能說老外搞得數(shù)據(jù)庫也就那樣，到了一定程度，他們也很亂，幾大主流數(shù)據(jù)庫之間有差異很正常。）dbSNP注明的是該位點有兩種allele，不是2種genotype~~~,genotype和allele有啥區(qū)別是不是你理解的不清楚呢？

BioStar

1. 我們芯片這個位點的"GG"基因型頻率為 27.33，沒有出現(xiàn)類似23andme的極端異常的情況；
2. 項目的優(yōu)化升級一直在進(jìn)行，包括本項目，還請關(guān)注；
3. SNPedia中(-;-)一般指Delet，?dbSNP也表明此位點只有2種Allele—A/G，由于此位點位于minus鏈，所以SNPedia和OpenSNP、以及某些文獻(xiàn)中提及的CC型，很有可能是GG型；
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