最近比較了一下公司幾個做了Ancestry，23andme和WeGene檢測的同事的數據，給大家羅列一下基本情況。下面所說的檢測數據都是從各自網站上下載的數據。

總位點數

當前三家下載的數據中顯示的位點數分別為：

• Ancestry：701479
• 23andme：610544
• WeGene：596744

Ancestry的位點數量明顯比其他兩家多，23andme和WeGene沒有明顯區別。因為下載的數據通常都是經過Imputation分析后的結果，所以在幾十萬個位點這種數據量級上，下載的數據中的位點數量跟實際檢測位點數并沒有必然關系。

位點重疊情況

三家公司的數據中的位點的重疊情況如下:

• Ancestry & WeGene: 262944
• Ancestry & 23andme: 307481
• 23andme & WeGene: 460996
• Ancestry & 23andme & WeGene: 258607

可以看出，WeGene跟23andme的重疊率很高，這從WeGene檢測的技術白皮書里也能看到。Ancestry跟WeGene和23andme的重疊率也超過40%，位點數超過了25萬個位點。如果用于大規模人群的基因組群體研究和分析，這三家所積累的數據是可以整合在一起使用的。

位點在染色體上的分布情況


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三家的位點在各個染色體上的分布見上圖。常染色體基本上一致，稍微奇葩點的是Ancestry在線粒體上沒有位點，在Y染色體上的位點不足一千個，而WeGene在Y染色體上有超過2W個位點——WeGene對Y單倍群分析是真愛啊。
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利益相關：我是WeGene的~~~