微基因檢測結(jié)果轉(zhuǎn)入DNA.LAND、MYHERITAGE、GEDMATCH全攻略


眾所周知，微基因和國外的知名檢測機構(gòu)23andeme所檢測位點的吻合度非常的高，而很多在國際上比較出名的檢測平臺，都支持23andme格式的原始數(shù)據(jù)到導(dǎo)入，因此微基因通過格式轉(zhuǎn)換的方式，可以上傳到其他平臺，對常染分析、尋找親屬等有很大的幫助。

無論上傳到什么平臺，首先都需要在微基因的官方網(wǎng)站上下載原始核心數(shù)據(jù)、另外為了轉(zhuǎn)換后的質(zhì)量能盡可能的兼容所有平臺，還需要下載經(jīng)過微基因計算處理的擴展數(shù)據(jù)。具體下載方法如下：
在微信端首先設(shè)置好自己微基因賬戶的密碼，使用電腦登錄和下載數(shù)據(jù)需要用戶密碼。密碼設(shè)置在微基因公眾號下點 我的基因----我（右下方）----拉到底設(shè)置-----修改密碼。如果不知道自己的用戶名可以用之前綁定的郵箱登錄。如果沒有綁定郵箱查看用戶名的辦法是：我的基因----我（右下方）---上方頭像右側(cè)的就是您自己設(shè)置的用戶名。
下載微基因官方核心數(shù)據(jù)和擴展數(shù)據(jù)：首先使用電腦登錄微基因官方網(wǎng)站 www.sofreetech.com 然后將鼠標(biāo)移到網(wǎng)頁上探索出，點擊原始數(shù)據(jù)，點擊藍(lán)色的點擊下載，底下的基因數(shù)據(jù)就是您的賬戶下所綁定的所有樣本的數(shù)據(jù)，選擇所要下載的樣本點擊核心數(shù)據(jù)下載和擴展數(shù)據(jù)下載。其中核心數(shù)據(jù)下載V1版本為一個十幾兆的txt文件，如果是V2芯片的數(shù)據(jù)，文件是二十幾兆，文件名為樣本名，擴展數(shù)據(jù)需要點擊下載后等待一到兩分鐘計算好后進(jìn)行下載，文件為zip文件，文件名為編號。
轉(zhuǎn)換成23andme格式文件：
首先需要登錄文件轉(zhuǎn)換插件網(wǎng)站 http://joshua.galaxy.42dna.com/wgto23/
WeGene基因數(shù)據(jù)上傳下載好的核心數(shù)據(jù) txt文件
WeGene擴展數(shù)據(jù)選擇下載好的zip格式文件的文件
千萬不要忘記勾選底下的確認(rèn)使用擴展數(shù)據(jù)，否則計算的文件可能不會被Myheritage識別，耐心等待文件的上傳和轉(zhuǎn)換文件的生成 ，生成后默認(rèn)的文件名是sim_23_核心文件的名字.txt

如果您的數(shù)據(jù)是微基因第二代芯片測出來的（辨認(rèn)方法為：第二代芯片測試結(jié)果核心文件為二十幾兆） 請勾選wegene V2版本 轉(zhuǎn)23andme V5版本的對號。這樣轉(zhuǎn)換結(jié)果為23andme最新格式文件。位點也大大增加。

～～～～～～～～～～～～～～～～～～～～～對于擔(dān)心上傳基因文件轉(zhuǎn)換，會造成隱私泄露的朋友，文章底部提供了相關(guān)的單機版本轉(zhuǎn)換器，還包含了魔方或微基因v1版本轉(zhuǎn)23andme的任意版本轉(zhuǎn)換器，以及微基因v2轉(zhuǎn)23andmev5的 專門的單機版轉(zhuǎn)換器。 作者是莊兄。
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下面您就有和23andmeV4或者V5高度相似的原始文件了，可以由此開始肆無忌憚的進(jìn)行所有兼容23andme格式文件的網(wǎng)站的平臺上傳。這里主要講Gedmatch、DNA.LAND、Myheritage三個網(wǎng)站。

Gedmatch

Gedmatch與另外兩個網(wǎng)站不同。Gedmatch支持微基因官方出版的原始數(shù)據(jù)，只要使用微基因的原始數(shù)據(jù)就可以進(jìn)行數(shù)據(jù)的上傳。

因為gedmatch進(jìn)行了系統(tǒng)升級，因此更換了上傳和使用網(wǎng)址，以下教程適用于新的網(wǎng)址，使用原網(wǎng)址上傳的kit會自動轉(zhuǎn)移到新的網(wǎng)址，用戶名和密碼沒有改變。

該網(wǎng)站部分插件對國內(nèi)進(jìn)行了屏蔽，因此登錄前需要額外設(shè)置 設(shè)置方法點以下鏈接：
Gedmatch無法正常使用的解決方案

步驟一：登錄網(wǎng)站 https://genesis.gedmatch.com/

步驟二： Click HERE to register. 點擊這里藍(lán)色的HERE進(jìn)行賬號注冊（該網(wǎng)站為英文網(wǎng)站，如果大家有英文閱讀困難建議使用網(wǎng)絡(luò)辭典）? ? ? 注：如果在原gedmatch網(wǎng)站有相關(guān)賬號密碼 直接輸入登錄即可

步驟三：在網(wǎng)站主頁登錄賬號

步驟四：點擊網(wǎng)頁中Upload your DNA files - for Genesis BETA ONLY下的第一個Generic Uploads (23andme, FTDNA,AncestryDNA, most others)選項

步驟五：根據(jù)其中英文提示填寫樣本信息，可以只填寫姓名 性別 和這個樣本的來源。（需要注意的是，這里面有兩個yes no的選項。第一個如果不選擇yes無法上傳，第二個如果不選擇yes功能部分限制使用。最后幾個選擇項根據(jù)情況填寫，選擇前幾個的選擇項是可以上傳的。）?
資料填好，點擊選擇文件 選取微基因官網(wǎng)下載的核心數(shù)據(jù)即可，點擊Upload。上傳之后耐心等待 上傳成功后會出現(xiàn)一個Kit Num 這個很重要需要記住。如果不小心沒記住也不要緊，賬號登錄網(wǎng)站后，左下方Y(jié)our DNA Resources下 左側(cè)是您的kit號 右側(cè)是您輸入的樣本名。

在上傳后，原各地match可以立即查看Admixture (heritage) 下的各種計算器對比。現(xiàn)在要等到Kit has not yet completed matching with other kits狀態(tài)才能使用該功能。耗時一般在一天之內(nèi)。其中很多計算器不是很適用于亞洲人，常染計算器是需要橫向比較的，其中很多計算器的比較意義并不大，我就不在教程貼贅述了，以后另行開貼講解。
另外One to one 這種一對一的基因關(guān)系對比原網(wǎng)站也是可以立即對比的，可以看看兩個KIT號有沒有所對應(yīng)的關(guān)系。現(xiàn)在和Admixture功能一樣 需要等待大概一天時間。

不能立即查看的是One to many功能。這個就是把你的Kit號和整個數(shù)據(jù)庫內(nèi)開通對比權(quán)限的KIT進(jìn)行對比，查看常染相關(guān)相同的關(guān)系，其中用英文描述的非常明白。
這個功能一般在一到兩天后可以使用。您可以通過您的kit后所對應(yīng)的圖例，參考網(wǎng)站首頁左邊KIT欄上方的圖例，判斷kit的狀態(tài)，kit上如果有藍(lán)色的對號，就是可以完全使用的狀態(tài)了。

其實gedmatch還有很多非常有趣的功能，比如說只需要你本人的KIT就可以通過Are your parents related?這里看到您父母是否有基因關(guān)系等等 其中的功能基因發(fā)燒友們可以自行開發(fā)。

另外如果發(fā)現(xiàn)自己的KIT 不能進(jìn)行多人對比可能是出現(xiàn)了權(quán)限問題。解決辦法很簡單，點擊左下角的EDIT or DELETE your DNA resource profiles.選擇您要編輯的kit右邊的SELECT，選擇PUBLIC后選擇SAVE即可。

DNA.LAND

DNA.LAND需要使用事先準(zhǔn)備好的轉(zhuǎn)換成23andme格式的數(shù)據(jù)，就是那個sim開頭的txt文檔。
步驟一 登錄http://dna.land

步驟二 點擊LOG-IN/REGISTER 在左側(cè)注冊賬號 郵箱 確認(rèn)郵箱 密碼 確認(rèn)密碼

步驟三 在右側(cè)進(jìn)入登錄進(jìn)去后 點擊UPLOAD NEW KIT 如果對協(xié)議內(nèi)容無異議勾選網(wǎng)頁底部的對號 點擊底下藍(lán)色的 I AGREE：CONTINUE

步驟四 選擇上面藍(lán)色的SELECT FILE （注意不是點底下的23andme的圖標(biāo)）選擇事先準(zhǔn)備好的23andme格式的txt文件

步驟五 填寫左側(cè)的 Personal Information 帶紅色星號的必須輸入，看情況勾選底下的三個對號 點擊右下角的 PROCEED TO DNA.LAND 耐心等待上傳 上傳成功后會跳轉(zhuǎn)到其他的頁面。
DNA.Land 使用查看方法：登錄你的賬號后 左側(cè)是顯示你賬號下的KIT信息，選擇相應(yīng)的KIT，右邊的信息意思如下
Name（姓名） Status（狀態(tài)）
Ancestry Report（祖源報告） view（查看）
Find Relatives （尋找親屬） view（查看）
Find Relatives of Relatives（尋找親屬的親屬） view（查看）
Trait Prediction Report （特征預(yù)測） view（查看）

其中祖源報告和尋親功能等需要等待系統(tǒng)處理的時間不同，都不是可以馬上使用的，一般祖源功能的等待時間是一到兩天，尋親功能視情況而定。祖源功能下是有相關(guān)的樣本采集地的詳解的，大家可以仔細(xì)閱讀，以后會開貼分析DNALAND的常染計算特點，這里不進(jìn)行贅述了。



Myheritage
和DNA.LAND一樣，需要使用事先準(zhǔn)備好的轉(zhuǎn)換成23andme格式的數(shù)據(jù)，就是那個sim開頭的txt文檔。
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現(xiàn)在Myheritage網(wǎng)站的祖源分析功能已經(jīng)開始收費，原上傳kit繼續(xù)不收費，所以說之前上傳kit的同志占了便宜。但是尋親功能可以正常使用。另外，如果你之前上傳過你親屬的kit，其實你可以鉆個小漏洞，就是上傳這個kit后，等兩個kit匹配到了基因關(guān)系，在之前上傳的kit的親緣關(guān)系里尋找新上傳的kit，通過成分對比查看新kit的祖源成分。
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以下是上傳操作方法：

步驟一：登錄 www.myheritage.com或者www.myheritage.cn

步驟二：點擊注冊注冊賬號 拉倒網(wǎng)頁最下方 選擇點擊開始 click to start

步驟三：選填樣本信息 點開始啟動

步驟四：忽略家譜功能，需要輸入自己的相關(guān)信息，登錄賬號

步驟五：點擊網(wǎng)頁上方DNA 選擇 Upload DNA data 點擊START 如果是自己的DNA kit，可以選擇Mine 如果是別人的 選擇Some one else’s 如果沒有異議勾選底下的所有對號 別人的樣本要填好信息。點擊Upload 選擇準(zhǔn)備好的23andeme文件上傳。耐心等待。

和DNALAND相同，其中數(shù)據(jù)處理需要時間，不會馬上出結(jié)果。其中所有結(jié)果都在DNA選項下，功能和其他平臺類似。一到兩天后可以查看轉(zhuǎn)換結(jié)果。其中也有包括祖源尋親在內(nèi)的各種功能。而且這個網(wǎng)站有家譜相關(guān)功能，具體大家可以慢慢開發(fā)，先不一一講解，今天有點小累了，我回頭重新編輯。




大家如果出結(jié)果了，或者有什么問題，可以在帖子下方留言提問，我盡自己所能幫助大家，謝謝各位支持，轉(zhuǎn)載請說明轉(zhuǎn)帖自小可愛老王，再次感謝。



單機版轉(zhuǎn)換器下載

wegene2.0轉(zhuǎn)23andme_V5軟件，54萬位點完美匹配

wegene2.0與23andme_V5有545337個常染位點重合，但與23andme_V4則僅有30多萬個重合。如果用V4上傳Dna.land等第三方網(wǎng)站分析，則會浪費20多萬個位點，體現(xiàn)不出wegene2.0的優(yōu)勢。
所以，奉獻(xiàn)一個wegene2.0轉(zhuǎn)23andme_V5軟件，完美支持Dna.land等網(wǎng)站上傳。

轉(zhuǎn)換器下載地址 （轉(zhuǎn)化器作者為莊生）
http://res.imtt.qq.com/m_download_qb/qbload_new_1.html

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任意格式轉(zhuǎn)23andme軟件 鏈接：https://pan.baidu.com/s/1nvqIZrrdwm1dr7o5sMe-Rg

作者:莊生


單機版軟件比web版本的優(yōu)勢有二：
第一，本軟件為單機版，不存在基因數(shù)據(jù)泄露給非必須第三方的風(fēng)險。
第二，本軟件根據(jù)可靠的SNP編號進(jìn)行篩選，而非相對不可靠的染色體位置信息。
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V2版本轉(zhuǎn)換站內(nèi)鏈接


還沒購買微基因產(chǎn)品的小伙伴，這里有微基因標(biāo)準(zhǔn)版/菁英版，減價購買入口，欲購從速：
http://www.sofreetech.com/shop/?_source=R_120066_68C83D



最后聲明:

樓主本人不鼓勵大家把自己的原始數(shù)據(jù)以及如bam文件等相關(guān)基因文件傳到國外機構(gòu)（如gedmatch dnaland yfull等），這個行為涉嫌違法，如果是自己的數(shù)據(jù)的話不會有人追究，但收集他人數(shù)據(jù)傳到國外或鼓動他人上傳到國外很可能違反《人類遺傳資源管理暫行辦法》http://www.most.gov.cn/bszn/new/rlyc/wjxz/200512/t20051226_55327.htm

第二條 本辦法所稱人類遺傳資源是指含有人體基因組、基因及其產(chǎn)物的器官、組織、細(xì)胞、血液、制備物、重組脫氧核糖核酸（DNA）構(gòu)建體等遺傳材料及相關(guān)的信息資料。
這里包括人類的DNA相關(guān)的信息資料。

第四條 國家對重要遺傳家系和特定地區(qū)遺傳資源實行申報登記制度，發(fā)現(xiàn)和持有重要遺傳家系和特定地區(qū)遺傳資源的單位或個人，應(yīng)及時向有關(guān)部門報告。未經(jīng)許可，任何單位和個人不得擅自采集、收集、買賣、出口、出境或以其他形式對外提供。

但是下載自己的數(shù)據(jù)是完全合法的，而且如果上傳到y(tǒng)full的確對確認(rèn)下游，尋找父系非常有幫助。樓主對此不阻攔，雖然高通上傳yfull很有用，但是樓主明確不鼓勵，請自行衡量。

國內(nèi)的基因網(wǎng)站，比較明確的一點是，給基因助手授權(quán)數(shù)據(jù)是完全合法的，請各位放心。
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基因助手網(wǎng)址：http://mahui.me/gene/

本帖的開帖目的，是為了給在境外的基因愛好者研究相關(guān)數(shù)據(jù)提供方便教程，你們本人上傳自己的數(shù)據(jù)是不會被追究的，而且的確很有用，尤其是高通上樹，但是本人明確不鼓勵這種行為，再次聲明，明確不鼓勵。謝謝各位愛好者的支持。