
通過(guò)基因來(lái)檢測(cè)患癌幾率的一些看法
轉(zhuǎn)發(fā)下我在知乎上的一個(gè)回答:
首先要明確的一點(diǎn)是,癌癥的發(fā)病機(jī)理是十分復(fù)雜的。衣食住行方方面面都會(huì)對(duì)腫瘤的形成做出貢獻(xiàn)。以研究的比較多的乳腺癌為例,與發(fā)病率顯著相關(guān)的包括以下幾點(diǎn):
這些風(fēng)險(xiǎn)中的“有乳腺癌家族史”這一項(xiàng),有很大一部分就是遺傳的風(fēng)險(xiǎn),也就是“基因”導(dǎo)致的患病風(fēng)險(xiǎn)。
要說(shuō)明基因檢測(cè)是否能有效預(yù)測(cè)癌癥的患病風(fēng)險(xiǎn),首先就要知道癌癥與基因到底有什么關(guān)系。
首先,癌癥與區(qū)別于其他疾病最重要的一點(diǎn),就是它是一個(gè)“基因病”,幾乎所有癌細(xì)胞中都能找到明顯的基因突變。得益于測(cè)序費(fèi)用的降低,最近幾年積累了大量的癌癥基因組的數(shù)據(jù)。比如TheCancerGenomeAtlas?Research?Network, TCGA,目前針對(duì)常見(jiàn)的癌癥都作了大規(guī)模的癌組織/正常組織的對(duì)比分析,數(shù)據(jù)包括基因組、轉(zhuǎn)錄組等各個(gè)組學(xué),來(lái)看下乳腺癌的突變情況:
引用自:Comprehensive molecular portraits of human breast tumours, doi:10.1038/nature11412
為何癌癥基因組與正常組織差距如此之大?
現(xiàn)在主流的觀點(diǎn),癌癥的發(fā)展和達(dá)爾文的進(jìn)化論有很大的相似之處。癌細(xì)胞不斷的分裂過(guò)程中,基因組也在不斷的變異,有更高的生存優(yōu)勢(shì)的細(xì)胞接積累的越多。
Wellcome Trust Sanger Institute在他們的一篇乳腺癌論文中,通過(guò)超高深度的全基因組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)乳腺癌的發(fā)展并不是一蹴而就的,而是通過(guò)不斷的基因突變的積累,乳腺才從完全正常的組織,一步步發(fā)展成高度復(fù)雜的,有多種癌細(xì)胞亞克隆群體的癌組織。在這一過(guò)程中,在最早的祖先癌細(xì)胞出現(xiàn)前,乳腺細(xì)胞就已經(jīng)有了驅(qū)動(dòng)癌癥發(fā)生的突變,如PIK3CA,TP53,ERBB2,?MYC,?CCND1等。這些腫瘤驅(qū)動(dòng)基因的突變(driver gene mutation),會(huì)大大增加乳腺癌的患病風(fēng)險(xiǎn)。 (話說(shuō)當(dāng)年看到這個(gè)paper真是佩服的一塌糊涂,單個(gè)樣本高深度測(cè)序就能把這么復(fù)雜的過(guò)程給推測(cè)出來(lái)了,媽媽問(wèn)我為什么跪著看論文……)
所以驅(qū)動(dòng)突變的出現(xiàn),就相當(dāng)于朝著癌癥邁進(jìn)了一小步。而很多驅(qū)動(dòng)突變,都是在被稱之為
腫瘤抑制基因(tumor suppressor gene)和原癌基因(oncogene)上的。比如在乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)基因中,最常被提及的BRCA1及BRCA2,都是腫瘤抑制基因。它們的主要功能是參與DNA損傷修復(fù),和維持基因組的穩(wěn)定性。如果這兩個(gè)基因發(fā)生影響其功能的變異,則腫瘤驅(qū)動(dòng)基因的突變出現(xiàn)的時(shí)候難以被有效的修復(fù),乳腺細(xì)胞癌化的可能性就會(huì)大大增加,甚至也會(huì)增加其他癌癥的風(fēng)險(xiǎn)。
所以,基因和腫瘤有沒(méi)有關(guān)系?答案很明顯,有關(guān)系,而且還不小。
如題主所說(shuō),目前市場(chǎng)上已經(jīng)開(kāi)始出現(xiàn)很多基因檢測(cè)來(lái)預(yù)測(cè)癌癥風(fēng)險(xiǎn)的產(chǎn)品了,有類(lèi)似安吉麗娜·朱莉那樣的測(cè)完整的BRCA1/BRCA2的基因來(lái)推測(cè)乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)的,也有檢測(cè)一堆多態(tài)性(SNP)位點(diǎn),來(lái)評(píng)估相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)的。
這些檢測(cè),靠譜嗎?
我個(gè)人的判斷是,大部分的這類(lèi)檢測(cè)至少都是有一定科學(xué)依據(jù)的。在癌癥的研究方面,我們積累的數(shù)據(jù)量已經(jīng)很多很多了,大部分的癌癥都做過(guò)易感性的研究,結(jié)合這幾年測(cè)序技術(shù)在癌癥領(lǐng)域的應(yīng)用,高頻率的driver gene mutation也找的差不多了。所以參與這些檢測(cè),如果真的檢測(cè)結(jié)果是高風(fēng)險(xiǎn)的話,受檢測(cè)者確實(shí)需要多警惕,注意進(jìn)行恰當(dāng)?shù)陌┌Y風(fēng)險(xiǎn)管理。
比如像朱莉那樣,BRCA1/BRCA2上發(fā)現(xiàn)純合且顯著改變基因功能的突變,可能終生的患病風(fēng)險(xiǎn)能到80%以上。這樣的情況下,切除乳腺組織就是非常理性的選擇。而且市面上已經(jīng)出現(xiàn)了降低得乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)的藥物,如他莫昔芬,雷洛昔芬等。就算不手術(shù),不服藥,單純的增加體檢頻率,早起發(fā)現(xiàn)癌癥的話也能極大提高患者的5年生存率。
現(xiàn)在回到題主的問(wèn)題上來(lái),為什么國(guó)內(nèi)的群眾大多不認(rèn)可或者是覺(jué)得沒(méi)有必要呢?
我覺(jué)得主要有以下幾點(diǎn):
1. 最重要的一點(diǎn),是大家對(duì)基因檢測(cè)的不了解。不做基因這塊領(lǐng)域的,對(duì)基因是什么基本沒(méi)有比較清晰的概念,大家最能說(shuō)得上來(lái)的可能是“克隆”、“轉(zhuǎn)基因”之類(lèi)的概念。不是聽(tīng)起來(lái)像魔法,就是在輿論中被妖魔化了。而真正做這塊的,也大部分在科研醫(yī)療機(jī)構(gòu),對(duì)民眾的宣傳科普的工作做得并不好。
2. 第二點(diǎn),是基因檢測(cè)推斷癌癥風(fēng)險(xiǎn)并不能完美預(yù)報(bào)個(gè)體的患病風(fēng)險(xiǎn)。不像單基因病,突變ó得病幾乎是完全對(duì)應(yīng)的關(guān)系,基因、遺傳并不是導(dǎo)致癌癥的唯一因素。乳腺癌為例,大概只有10%的乳腺癌是可以確切證明是由遺傳導(dǎo)致的。剩下的90%?基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)不了這些風(fēng)險(xiǎn)。而且限于成本,目前B2C市場(chǎng)的大多數(shù)檢測(cè)產(chǎn)品,都是對(duì)少部分基因、位點(diǎn)的檢測(cè),不可能覆蓋全基因組的解讀。
3. 第三點(diǎn),是沒(méi)有很好的風(fēng)險(xiǎn)管理的辦法。雖然NCCN發(fā)布過(guò)《breast cancer risk reduction》、《genetic/Familial high-risk assessment:Breast cancer and pvarian》等指導(dǎo)性的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和降低風(fēng)險(xiǎn)的指南,但是國(guó)內(nèi)有條件,而且有意愿按照指南健康管理的機(jī)構(gòu)并不常見(jiàn)。對(duì)于普羅大眾,抽煙喝酒這些對(duì)健康有極大損害的事情也沒(méi)辦法完全戒掉,能有超前癌癥的預(yù)防和風(fēng)險(xiǎn)管理的意識(shí)的人就更稀少了。
不過(guò),國(guó)內(nèi)的基因檢測(cè)服務(wù)已經(jīng)開(kāi)始日益成熟起來(lái)。尤其現(xiàn)在google,BAT等大型互聯(lián)網(wǎng)機(jī)構(gòu)也開(kāi)始涉足基因領(lǐng)域,很多保險(xiǎn)公司也開(kāi)始與基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)有合作的產(chǎn)品推出。隨著更多資金的投入,相信會(huì)有更多人能夠了解基因檢測(cè),也會(huì)有更多人樂(lè)于去了解自己的遺傳背景,畢竟癌癥現(xiàn)在還是頭號(hào)的殺手,能多了解一點(diǎn)有什么不好的呢?
再補(bǔ)充一句,個(gè)人十分看好互聯(lián)網(wǎng)(恐怖的流量)+ 基因檢測(cè)(精確的技術(shù)、解讀) + 保險(xiǎn)服務(wù)(風(fēng)險(xiǎn)管理)+ 線下醫(yī)院服務(wù)這樣的合作模式。智能手機(jī)只用了幾年時(shí)間就徹底改變了我們的生活方式,這種多方聯(lián)合的健康管理模式我覺(jué)得也有機(jī)會(huì)再次改變我們的生存模式。這中間需要探索的地方還有很多,然而可供想象的空間也極大。
以上。
首先要明確的一點(diǎn)是,癌癥的發(fā)病機(jī)理是十分復(fù)雜的。衣食住行方方面面都會(huì)對(duì)腫瘤的形成做出貢獻(xiàn)。以研究的比較多的乳腺癌為例,與發(fā)病率顯著相關(guān)的包括以下幾點(diǎn):
這些風(fēng)險(xiǎn)中的“有乳腺癌家族史”這一項(xiàng),有很大一部分就是遺傳的風(fēng)險(xiǎn),也就是“基因”導(dǎo)致的患病風(fēng)險(xiǎn)。
要說(shuō)明基因檢測(cè)是否能有效預(yù)測(cè)癌癥的患病風(fēng)險(xiǎn),首先就要知道癌癥與基因到底有什么關(guān)系。
首先,癌癥與區(qū)別于其他疾病最重要的一點(diǎn),就是它是一個(gè)“基因病”,幾乎所有癌細(xì)胞中都能找到明顯的基因突變。得益于測(cè)序費(fèi)用的降低,最近幾年積累了大量的癌癥基因組的數(shù)據(jù)。比如TheCancerGenomeAtlas?Research?Network, TCGA,目前針對(duì)常見(jiàn)的癌癥都作了大規(guī)模的癌組織/正常組織的對(duì)比分析,數(shù)據(jù)包括基因組、轉(zhuǎn)錄組等各個(gè)組學(xué),來(lái)看下乳腺癌的突變情況:
引用自:Comprehensive molecular portraits of human breast tumours, doi:10.1038/nature11412
為何癌癥基因組與正常組織差距如此之大?
現(xiàn)在主流的觀點(diǎn),癌癥的發(fā)展和達(dá)爾文的進(jìn)化論有很大的相似之處。癌細(xì)胞不斷的分裂過(guò)程中,基因組也在不斷的變異,有更高的生存優(yōu)勢(shì)的細(xì)胞接積累的越多。
Wellcome Trust Sanger Institute在他們的一篇乳腺癌論文中,通過(guò)超高深度的全基因組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)乳腺癌的發(fā)展并不是一蹴而就的,而是通過(guò)不斷的基因突變的積累,乳腺才從完全正常的組織,一步步發(fā)展成高度復(fù)雜的,有多種癌細(xì)胞亞克隆群體的癌組織。在這一過(guò)程中,在最早的祖先癌細(xì)胞出現(xiàn)前,乳腺細(xì)胞就已經(jīng)有了驅(qū)動(dòng)癌癥發(fā)生的突變,如PIK3CA,TP53,ERBB2,?MYC,?CCND1等。這些腫瘤驅(qū)動(dòng)基因的突變(driver gene mutation),會(huì)大大增加乳腺癌的患病風(fēng)險(xiǎn)。 (話說(shuō)當(dāng)年看到這個(gè)paper真是佩服的一塌糊涂,單個(gè)樣本高深度測(cè)序就能把這么復(fù)雜的過(guò)程給推測(cè)出來(lái)了,媽媽問(wèn)我為什么跪著看論文……)
所以驅(qū)動(dòng)突變的出現(xiàn),就相當(dāng)于朝著癌癥邁進(jìn)了一小步。而很多驅(qū)動(dòng)突變,都是在被稱之為
腫瘤抑制基因(tumor suppressor gene)和原癌基因(oncogene)上的。比如在乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)基因中,最常被提及的BRCA1及BRCA2,都是腫瘤抑制基因。它們的主要功能是參與DNA損傷修復(fù),和維持基因組的穩(wěn)定性。如果這兩個(gè)基因發(fā)生影響其功能的變異,則腫瘤驅(qū)動(dòng)基因的突變出現(xiàn)的時(shí)候難以被有效的修復(fù),乳腺細(xì)胞癌化的可能性就會(huì)大大增加,甚至也會(huì)增加其他癌癥的風(fēng)險(xiǎn)。
所以,基因和腫瘤有沒(méi)有關(guān)系?答案很明顯,有關(guān)系,而且還不小。
如題主所說(shuō),目前市場(chǎng)上已經(jīng)開(kāi)始出現(xiàn)很多基因檢測(cè)來(lái)預(yù)測(cè)癌癥風(fēng)險(xiǎn)的產(chǎn)品了,有類(lèi)似安吉麗娜·朱莉那樣的測(cè)完整的BRCA1/BRCA2的基因來(lái)推測(cè)乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)的,也有檢測(cè)一堆多態(tài)性(SNP)位點(diǎn),來(lái)評(píng)估相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)的。
這些檢測(cè),靠譜嗎?
我個(gè)人的判斷是,大部分的這類(lèi)檢測(cè)至少都是有一定科學(xué)依據(jù)的。在癌癥的研究方面,我們積累的數(shù)據(jù)量已經(jīng)很多很多了,大部分的癌癥都做過(guò)易感性的研究,結(jié)合這幾年測(cè)序技術(shù)在癌癥領(lǐng)域的應(yīng)用,高頻率的driver gene mutation也找的差不多了。所以參與這些檢測(cè),如果真的檢測(cè)結(jié)果是高風(fēng)險(xiǎn)的話,受檢測(cè)者確實(shí)需要多警惕,注意進(jìn)行恰當(dāng)?shù)陌┌Y風(fēng)險(xiǎn)管理。
比如像朱莉那樣,BRCA1/BRCA2上發(fā)現(xiàn)純合且顯著改變基因功能的突變,可能終生的患病風(fēng)險(xiǎn)能到80%以上。這樣的情況下,切除乳腺組織就是非常理性的選擇。而且市面上已經(jīng)出現(xiàn)了降低得乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)的藥物,如他莫昔芬,雷洛昔芬等。就算不手術(shù),不服藥,單純的增加體檢頻率,早起發(fā)現(xiàn)癌癥的話也能極大提高患者的5年生存率。
現(xiàn)在回到題主的問(wèn)題上來(lái),為什么國(guó)內(nèi)的群眾大多不認(rèn)可或者是覺(jué)得沒(méi)有必要呢?
我覺(jué)得主要有以下幾點(diǎn):
1. 最重要的一點(diǎn),是大家對(duì)基因檢測(cè)的不了解。不做基因這塊領(lǐng)域的,對(duì)基因是什么基本沒(méi)有比較清晰的概念,大家最能說(shuō)得上來(lái)的可能是“克隆”、“轉(zhuǎn)基因”之類(lèi)的概念。不是聽(tīng)起來(lái)像魔法,就是在輿論中被妖魔化了。而真正做這塊的,也大部分在科研醫(yī)療機(jī)構(gòu),對(duì)民眾的宣傳科普的工作做得并不好。
2. 第二點(diǎn),是基因檢測(cè)推斷癌癥風(fēng)險(xiǎn)并不能完美預(yù)報(bào)個(gè)體的患病風(fēng)險(xiǎn)。不像單基因病,突變ó得病幾乎是完全對(duì)應(yīng)的關(guān)系,基因、遺傳并不是導(dǎo)致癌癥的唯一因素。乳腺癌為例,大概只有10%的乳腺癌是可以確切證明是由遺傳導(dǎo)致的。剩下的90%?基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)不了這些風(fēng)險(xiǎn)。而且限于成本,目前B2C市場(chǎng)的大多數(shù)檢測(cè)產(chǎn)品,都是對(duì)少部分基因、位點(diǎn)的檢測(cè),不可能覆蓋全基因組的解讀。
3. 第三點(diǎn),是沒(méi)有很好的風(fēng)險(xiǎn)管理的辦法。雖然NCCN發(fā)布過(guò)《breast cancer risk reduction》、《genetic/Familial high-risk assessment:Breast cancer and pvarian》等指導(dǎo)性的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和降低風(fēng)險(xiǎn)的指南,但是國(guó)內(nèi)有條件,而且有意愿按照指南健康管理的機(jī)構(gòu)并不常見(jiàn)。對(duì)于普羅大眾,抽煙喝酒這些對(duì)健康有極大損害的事情也沒(méi)辦法完全戒掉,能有超前癌癥的預(yù)防和風(fēng)險(xiǎn)管理的意識(shí)的人就更稀少了。
不過(guò),國(guó)內(nèi)的基因檢測(cè)服務(wù)已經(jīng)開(kāi)始日益成熟起來(lái)。尤其現(xiàn)在google,BAT等大型互聯(lián)網(wǎng)機(jī)構(gòu)也開(kāi)始涉足基因領(lǐng)域,很多保險(xiǎn)公司也開(kāi)始與基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)有合作的產(chǎn)品推出。隨著更多資金的投入,相信會(huì)有更多人能夠了解基因檢測(cè),也會(huì)有更多人樂(lè)于去了解自己的遺傳背景,畢竟癌癥現(xiàn)在還是頭號(hào)的殺手,能多了解一點(diǎn)有什么不好的呢?
再補(bǔ)充一句,個(gè)人十分看好互聯(lián)網(wǎng)(恐怖的流量)+ 基因檢測(cè)(精確的技術(shù)、解讀) + 保險(xiǎn)服務(wù)(風(fēng)險(xiǎn)管理)+ 線下醫(yī)院服務(wù)這樣的合作模式。智能手機(jī)只用了幾年時(shí)間就徹底改變了我們的生活方式,這種多方聯(lián)合的健康管理模式我覺(jué)得也有機(jī)會(huì)再次改變我們的生存模式。這中間需要探索的地方還有很多,然而可供想象的空間也極大。
以上。
3 個(gè)回復(fù)
贊同來(lái)自:
WeGene當(dāng)前的復(fù)雜疾病檢測(cè)項(xiàng)目盡量努力的往科研,往參考數(shù)據(jù)整理方面去做,而不是給任何的意見(jiàn)。我想,幫助普通人把科研項(xiàng)目結(jié)果整理并翻譯出來(lái),通過(guò)數(shù)字羅列和顯示,這也可以是一個(gè)很有價(jià)值的事情,并不需要我們告訴用戶有什么風(fēng)險(xiǎn)有什么概率。
讓用戶用高性價(jià)比獲得基因數(shù)據(jù),幫用戶整理和翻譯科學(xué)文獻(xiàn)內(nèi)容,這是我們現(xiàn)在的產(chǎn)品設(shè)計(jì)目的。
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贊同來(lái)自: Vacual
現(xiàn)在從基礎(chǔ)研究的層面來(lái)看,我們對(duì)癌癥的了解還太少。我也參加過(guò)一些腫瘤基因組的項(xiàng)目,項(xiàng)目的成果最后也都發(fā)表在了很不錯(cuò)的學(xué)術(shù)期刊上。但我覺(jué)得,在各個(gè)研究項(xiàng)目中發(fā)現(xiàn)的新突變和新的跟某種腫瘤有關(guān)的基因,都只是反映了我們對(duì)癌癥的機(jī)理還沒(méi)有一個(gè)正確的認(rèn)識(shí)方法。
不過(guò),畢竟已經(jīng)積累了不少數(shù)據(jù),根據(jù)這些數(shù)據(jù)得到的統(tǒng)計(jì)結(jié)果和一些局部的認(rèn)識(shí)。現(xiàn)在的腫瘤風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,乃至早篩和個(gè)性化治療都是基于這些零碎的知識(shí)。固然已經(jīng)能解決一些問(wèn)題,極大的提高了生存期,但人類(lèi)對(duì)癌癥的全面征服還有很長(zhǎng)的路要走。
謝謝樓主的帖子
贊同來(lái)自: Vacual
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