AlphaFold是DeepMind公司下的一個預測蛋白質結構的AI，這個公司下的AI還有我們所熟悉的AlphaGo。它對大部分蛋白質結構的預測與真實結構只差一個原子的寬度，達到了人類利用冷凍電子顯微鏡等復雜儀器觀察預測的水平。該程序利用Python寫成。今天我們將利用它的云端Jupyter Notebook根據人的紅細胞H抗原的氨基酸序列對人的紅細胞H抗原的蛋白結構進行預測。
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首先先打開NCBI找到相關氨基酸序列，把它copy下來


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之后打開這個網址：?https://colab.research.google.com/github/deepmind/alphafold/blob/main/notebooks/AlphaFold.ipynb


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之后首先按順序運行前兩單元，安裝運行環境（這個安裝過程只會安裝到云端，不會安裝到本地，放心）
再將剛才copy的氨基酸序列放在圖中選中的部分，點運行（注意如果預測氨基酸序列來自于原核生物記得勾選is_prokaryote）

之后接著向下運行完所有單元（時間會比較長，因為會和數據庫對比）
運行完會自動下載預測好的蛋白質結構的PDB文件


之后可以利用pyMOL軟件在線下打開PDB文件，輸出圖片

你還可以通過這個軟件改變顏色


結果展示：




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現在我正在研究如何把PDB文件轉換為STL文件，之后或許能將預測結構用3D打印機打印出來，敬請期待～
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