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商冠東 商冠東 綜合討論組

對于一個想學習生物信息學的人來說,Wegene提供給我的自己的SNP文件有什么用么

求助各位大神,我想利用Wegene給我的原始數據,來學習些生信分析。。。不知道這個能怎么開展
2017-06-27 ? IP屬地南京
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4 個回復

zhengqiang - 勤奮學習
來了就能升級wgs數據,然后繼續學習。
費力科思 - WeGene勤雜工
可以考慮做這么幾個事情:
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1. 用千人基因組的數據,選擇自己感興趣的人群,構建一個訓練數據集,用Admixure軟件做一個自己的祖源成分分析;這個過程中你會熟悉千人基因組數據集,如何處理NGS的VCF文件,如何抽取和組合數據,如何使用Admixture軟件等等。
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2. 用Clinvar數據庫注釋你自己的所有SNP。這個過程你需要自己寫一些腳本,熟悉Clinvar數據庫,知道各種突變的描述方式,知道疾病相關位點的分類和表達方式等等。
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。。。
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最近發現一本書,叫exploering peronal genomics,序言是Church大神寫的,專門教你怎么玩個人基因組數據,可以看看。
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如果全部折騰明白了,請發簡歷給我,[email protected]
bunnyfz - O1a1b
O1a內部交流群群號;490879081。報是微基因的O1a.就可以了。
bunnyfz - O1a1b
F2911你好。怎么不加Q群呢?群里有專家

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