WeGene的Y單倍群計算最開始是簡單的自研算法。@wang 傳超同學加入后，建議我們參考學術界的算法并加以優化改進。
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現在WeGene所使用的Y單倍群算法的主要參考文獻是BMC Genomics上的這篇AMY-Tree，鏈接：http://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-14-101
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AMY-Tree算法原本是針對全基因組測序數據設計的，所以我們重新用Python實現了算法，并根據芯片數據的特點進行了優化和調整。正在整理論文和測試數據，盡快發布給大家。有時間會整理成一個單獨的開源程序放到github上。
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所使用的數據是源自AMY-Tree 2.0中所提供的2.1版的數據，這是2014年3月的數據。我們根據芯片對突變位點覆蓋情況以及考慮到我們的用戶主要是東亞人群，對數據做了清理。
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原AMY-Tree程序和數據下載地址：https://bio.kuleuven.be/eeb/lbeg/software
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