
祖源分析釋疑
WeGene飛速發展,在高端大氣上檔次的道路上越走越遠,與此同時,客戶對祖源分析的認識水平愈發深入,需求也日益膨脹:能否再細化細化細化???
這里開貼針對客戶反復提及的問題整理作答:
1. WeGene的祖源分析參考數據取自哪里?
千人基因組、HGDP和Human Origin項目,根據需要對上述數據進行分類、clean、整合。
2. WeGene的祖源分析能否再細化?
Y染色體和線粒體,我們已涵蓋了充足的位點,只要有足夠樣本能夠明確更下游的支系拓撲關系,我們就會馬上更新到您的譜系樹上;對常染色體,在半年內會新增加一批東亞參考人群數據,包括古代和高度區域化的現代樣本,將會給客戶提供更細化更準確的祖源構成結果。對歐洲人群,也將馬上采用相關古人數據進行祖源分析,解決祖源源流分歧,所用數據來自:
Lazaridis, I., et al. Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature 513, 409-413, (2014).
Jones, E. R., et al. Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of modern Eurasians. Nat Commun. 6, 8912, (2015).
祖源的細化細化再細化在技術上是一件很難的事情,但我們在不斷努力!
3. Y染色體和線粒體分型的參考依據?為什么WeGene給出的結果和其他檢測機構不一致?
Y染色體ISOGG:http://www.isogg.org/index.html
線粒體:http://www.phylotree.org/tree/index.htm
不一致很可能是由于不同檢測機構所使用的分型命名版本不一致,單倍群名稱是不斷更新的,WeGene按照最新的ISOGG和phylotree版本。
4. 東亞主要Y染色體和線粒體類型的分布和解讀?
Y染色體請參考我的論文:http://investigativegenetics.biomedcentral.com/articles/10.1186/2041-2223-4-11
中文版:http://blog.sciencenet.cn/blog-348453-699717.html
線粒體參考:http://www.sofreetech.com/question/201?
5. 為什么韓國人成分這么高?
參考我對韓國人祖源構成的分析:http://www.sofreetech.com/question/448
?
6. 為什么家人或同胞的祖源不一致?
答:細微差別算不上不一致,任何模擬都會有合理的偏差,區分高度同質的各漢族群體,5%甚至10%的誤差是很正常的;同胞的話,請看下是同性同胞還是異性同胞,因為女性比男性多出一條X染色體,會影響祖源分析;特別注明:WeGene不提供親緣鑒定,也不會給出親子關系結論。
?
7. 為什么我是北方人會有南方成分?我是南方人卻有北方成分?
南北方漢族的遺傳差異很小,參考:http://www.sofreetech.com/question/210
人群遺傳混合歷史是很復雜的,沒有人是100%純粹的南方或北方,即使你這一代或上幾代沒有混,也不能保證你的無數祖先沒有混過。
?
還有什么問題,提提提!!!
這里開貼針對客戶反復提及的問題整理作答:
1. WeGene的祖源分析參考數據取自哪里?
千人基因組、HGDP和Human Origin項目,根據需要對上述數據進行分類、clean、整合。
2. WeGene的祖源分析能否再細化?
Y染色體和線粒體,我們已涵蓋了充足的位點,只要有足夠樣本能夠明確更下游的支系拓撲關系,我們就會馬上更新到您的譜系樹上;對常染色體,在半年內會新增加一批東亞參考人群數據,包括古代和高度區域化的現代樣本,將會給客戶提供更細化更準確的祖源構成結果。對歐洲人群,也將馬上采用相關古人數據進行祖源分析,解決祖源源流分歧,所用數據來自:
Lazaridis, I., et al. Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature 513, 409-413, (2014).
Jones, E. R., et al. Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of modern Eurasians. Nat Commun. 6, 8912, (2015).
祖源的細化細化再細化在技術上是一件很難的事情,但我們在不斷努力!
3. Y染色體和線粒體分型的參考依據?為什么WeGene給出的結果和其他檢測機構不一致?
Y染色體ISOGG:http://www.isogg.org/index.html
線粒體:http://www.phylotree.org/tree/index.htm
不一致很可能是由于不同檢測機構所使用的分型命名版本不一致,單倍群名稱是不斷更新的,WeGene按照最新的ISOGG和phylotree版本。
4. 東亞主要Y染色體和線粒體類型的分布和解讀?
Y染色體請參考我的論文:http://investigativegenetics.biomedcentral.com/articles/10.1186/2041-2223-4-11
中文版:http://blog.sciencenet.cn/blog-348453-699717.html
線粒體參考:http://www.sofreetech.com/question/201?
5. 為什么韓國人成分這么高?
參考我對韓國人祖源構成的分析:http://www.sofreetech.com/question/448
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6. 為什么家人或同胞的祖源不一致?
答:細微差別算不上不一致,任何模擬都會有合理的偏差,區分高度同質的各漢族群體,5%甚至10%的誤差是很正常的;同胞的話,請看下是同性同胞還是異性同胞,因為女性比男性多出一條X染色體,會影響祖源分析;特別注明:WeGene不提供親緣鑒定,也不會給出親子關系結論。
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7. 為什么我是北方人會有南方成分?我是南方人卻有北方成分?
南北方漢族的遺傳差異很小,參考:http://www.sofreetech.com/question/210
人群遺傳混合歷史是很復雜的,沒有人是100%純粹的南方或北方,即使你這一代或上幾代沒有混,也不能保證你的無數祖先沒有混過。
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還有什么問題,提提提!!!
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下面是我的原帖子地址:http://www.sofreetech.com/question/4580
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